RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 ERLIN2O94905 339 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 ITGB1P05556 798 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 SKIP12755 728 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 NAALADL2Q58DX5 795 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 KRT79Q5XKE5 535 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 HLA-CQ95604 372 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 ASB2Q96Q27 587 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 TRAIPQ9BWF2 469 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 FOXD4L1Q9NU39 408 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 FAM105AQ9NUU6 356 aa34.13■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
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CMTM4-204ENST00000563952 TJAP1Q5JTD0 557 aa34.12■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 LPPQ93052 612 aa34.12■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
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CMTM4-204ENST00000563952 COG5Q9UP83 839 aa34.12■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa34.12■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
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CMTM4-204ENST00000563952 TCEAL5Q5H9L2 206 aa34.11■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC55Q6ZSA7 311 aa34.11■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 BRAPQ7Z569 592 aa34.11■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 LRRC43Q8N309 656 aa34.11■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa34.11■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 BHMT2Q9H2M3 363 aa34.11■■■■□ 3.05
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CMTM4-204ENST00000563952 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa34.1■■■■□ 3.05
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CMTM4-204ENST00000563952 TSPAN1O60635 241 aa34.09■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 LAG3P18627 525 aa34.09■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 CYP11B2P19099 503 aa34.09■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 MBTD1Q05BQ5 628 aa34.09■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 THNSL1Q8IYQ7 743 aa34.09■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 SPPL3Q8TCT6 385 aa34.09■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa34.08■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJB1P25685 340 aa34.08■■■■□ 3.05
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CMTM4-204ENST00000563952 AAK1Q2M2I8 961 aa34.08■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 CPB2Q96IY4 423 aa34.08■■■■□ 3.05
CMTM4-204ENST00000563952 MEIS3P2A8K0S8 358 aa34.07■■■■□ 3.04
CMTM4-204ENST00000563952 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.04
CMTM4-204ENST00000563952 POF1BQ8WVV4 589 aa34.07■■■■□ 3.04
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CMTM4-204ENST00000563952 DNM3Q9UQ16 869 aa34.07■■■■□ 3.04
CMTM4-204ENST00000563952 E9PMD0 336 aa34.06■■■■□ 3.04
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF623O75123 536 aa34.06■■■■□ 3.04
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CMTM4-204ENST00000563952 CAMK1Q14012 370 aa34.06■■■■□ 3.04
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CMTM4-204ENST00000563952 UBXN11Q5T124 520 aa34.06■■■■□ 3.04
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CMTM4-204ENST00000563952 AXLP30530 894 aa34.05■■■■□ 3.04
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CMTM4-204ENST00000563952 KCNQ1P51787 676 aa34.05■■■■□ 3.04
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CMTM4-204ENST00000563952 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
CMTM4-204ENST00000563952 DEPTORQ8TB45 409 aa34.01■■■■□ 3.03
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CMTM4-204ENST00000563952 CSRNP2Q9H175 543 aa34.01■■■■□ 3.03
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