RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 RSPH10BP0C881 870 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 IFNA8P32881 189 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRB-209ENST00000550857 RPS6KA1Q15418 735 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 MAN2A1Q16706 1144 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 PEX26Q7Z412 305 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 SAMD11Q96NU1 681 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-209ENST00000550857 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRB-209ENST00000550857 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRB-209ENST00000550857 TMED2Q15363 201 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRB-209ENST00000550857 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
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PTPRB-209ENST00000550857 EFHC2Q5JST6 749 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 EPAS1Q99814 870 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 POLLQ9UGP5 575 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 H7C0C1 242 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 ADH1AP07327 375 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 ACADMP11310 421 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5OP48047 213 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 DDR1Q08345 913 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 TAF11Q15544 211 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 SGO2Q562F6 1265 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.64□□□□□ -1.03
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