RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RUNDC1Q96C34 613 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 C8orf49Q96NF6 230 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SAMD11Q96NU1 681 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 KCND1Q9NSA2 647 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CBLCQ9ULV8 474 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 H0Y858 1186 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 WNT9AO14904 365 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 B4GALT4O60513 344 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CHGBP05060 677 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM17P78536 824 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RBL2Q08999 1139 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SOGA3Q5TF21 947 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC7Q99615 494 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SLIT2O94813 1529 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 MAN2B1O00754 1011 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 KCNK3O14649 394 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 EFCAB14O75071 495 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL18O94889 574 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 KNG1P01042 644 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 AMY2AP04746 511 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 AMY2BP19961 511 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 GJA4P35212 333 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RIPK4P57078 832 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 JAM2P57087 298 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2CBP62714 309 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2CAP67775 309 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 DCTN1Q14203 1278 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZUG5 572 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 OSTM1Q86WC4 334 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SRRDQ9UH36 339 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 NRAPQ86VF7 1730 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 MEGF6O75095 1541 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CRB1P82279 1406 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 KDRP35968 1356 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 IL18BPO95998 194 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 IL2RBP14784 551 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 VPS72Q15906 364 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 NFE2L2Q16236 605 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 MKL1Q969V6 931 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RASGRP1O95267 797 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 EPHB4P54760 987 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CPZQ66K79 652 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 MCM10Q7L590 875 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 UBXN4Q92575 508 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC6O95255 1503 aa6.09□□□□□ -1.44
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