RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 VAMP7P51809 220 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 PPATQ06203 517 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CETN1Q12798 172 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 KIF22Q14807 665 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 EBAG9O00559 213 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 RFX1P22670 979 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 GCLMP48507 274 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CPXCR1Q8N123 301 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 GMLQ99445 158 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 AGPAT1Q99943 283 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD62A6NC57 917 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 PTGER2P43116 358 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 CORO7P57737 925 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 PPP3CAQ08209 521 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 MYBPC2Q14324 1141 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ACCSQ96QU6 501 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 COG5Q9UP83 839 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ZNF536O15090 1300 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D12O60347 775 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 RARRES1P49788 294 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 GUCY1A3Q02108 690 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 DPH5Q9H2P9 285 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 NR2E1Q9Y466 385 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 FLT3P36888 993 aa22.15■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.15■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TMEM150BA6NC51 233 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 NDUFAB1O14561 156 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ASNSP08243 561 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 MYZAPP0CAP1 466 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ALAS1P13196 640 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 PLS3P13797 630 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 USP8P40818 1118 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 TKFCQ3LXA3 575 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
IMP4-208ENST00000460766 RPTORQ8N122 1335 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MTMR1Q13613 665 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ALCAMQ13740 583 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 COPB2P35606 906 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MAGEA9P43362 315 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 CARD9Q9H257 536 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 H0YGN5 161 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 LSP1P33241 339 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 NFS1Q9Y697 457 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 SLC16A4O15374 487 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-208ENST00000460766 PEX3P56589 373 aa22.12■■□□□ 1.13
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