RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 NLRP7Q8WX94 980 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 FIZ1Q96SL8 496 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GBP3Q9H0R5 595 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 THAP9Q9H5L6 903 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 STARD7Q9NQZ5 370 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TBX20Q9UMR3 447 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 DNM1LO00429 736 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CETN3O15182 167 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TREHO43280 583 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R37O75864 691 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TFRCP02786 760 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 VTNP04004 478 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 LIG4P49917 911 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PMS1P54277 932 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NCAPHQ15003 741 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MAPK6Q16659 721 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TTI2Q6NXR4 508 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ARMCX5Q6P1M9 558 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 FOXR2Q6PJQ5 311 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF410Q86VK4 478 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NME8Q8N427 588 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R16BQ96T49 567 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 KCTD10Q9H3F6 313 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PQY0 241 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CLIC2O15247 247 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CBFA2T2O43439 604 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PRKCBP05771 671 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TPM3P06753 285 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NR2F2P24468 414 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 POU5F1BQ06416 359 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 FILIP1LQ4L180 1135 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SESTD1Q86VW0 696 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MAP4K3Q8IVH8 894 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CEP63Q96MT8 703 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 STRA6Q9BX79 667 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM5Q9C035 493 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 A0A087WZ62 844 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ18B7U540 433 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ERLIN2O94905 339 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GNA14O95837 355 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NR3C1P04150 777 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GJB1P08034 283 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ADAM17P78536 824 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 KCNA1Q09470 495 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ADAM9Q13443 819 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ12Q14500 433 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PTGISQ16647 500 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ZCWPW2Q504Y3 356 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CEP135Q66GS9 1140 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SLFN12LQ6IEE8 588 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF333Q96JL9 665 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRK-201ENST00000368202 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms