RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353468.4

SIGMAR1-202, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SIGMAR1, Length 1,582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-202ENST00000353468 A0A1W2PQY0 241 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 MRE11P49959 708 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TPM4P67936 248 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 NLRP4Q96MN2 994 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.12■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PDXKO00764 312 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 POU5F1BQ06416 359 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.11■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 K7ERI5 159 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 SGPL1O95470 568 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 GBP3Q9H0R5 595 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.1■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TGFB1I1O43294 461 aa22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 EFNA5P52803 228 aa22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PTENP60484 403 aa22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 CDC42EP1Q00587 391 aa22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 A0A087WZ62 844 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 GPC3P51654 580 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 STRN3Q13033 797 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 NME8Q8N427 588 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.08■■□□□ 1.13
SIGMAR1-202ENST00000353468 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 PHKA2P46019 1235 aa22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 PTGISQ16647 500 aa22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZNF410Q86VK4 478 aa22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 NLRP7Q8WX94 980 aa22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 THAP9Q9H5L6 903 aa22.08■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 CLIC2O15247 247 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZNF18P17022 549 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 SERINC5Q86VE9 423 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 SCLT1Q96NL6 688 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 BRCA2P51587 3418 aa22.07■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 ARVCFO00192 962 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 GPR32O75388 356 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 NFIL3Q16649 462 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 MAPK6Q16659 721 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 PLCB2Q00722 1185 aa22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 ADAM9Q13443 819 aa22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 KIZQ2M2Z5 673 aa22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 BICD1Q96G01 975 aa22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SIGMAR1-202ENST00000353468 FZD8Q9H461 694 aa22.05■■□□□ 1.12
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