RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 PPTC7Q8NI37 304 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ACRP10323 421 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF365Q70YC5 407 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 MTERF2Q49AM1 385 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 DRC7Q8IY82 874 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 FIZ1Q96SL8 496 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 MMP3P08254 477 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 RFC5P40937 340 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 CASP5P51878 434 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 AFG1LQ8WV93 481 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 POLD4Q9HCU8 107 aa22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 KCNJ18B7U540 433 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 PDXKO00764 312 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 PPFIA4O75335 1185 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 MYBP10242 640 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 SMTNP53814 917 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 CCL23P55773 120 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 KCNJ12Q14500 433 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 HS1BP3Q53T59 392 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 HERVK_113Q902F9 699 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 SCN5AQ14524 2016 aa22.9■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 CYP2C9P11712 490 aa22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 DNAJB2P25686 324 aa22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 VWCEQ96DN2 955 aa22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
DUSP28-201ENST00000343217 A0A1B0GTH6 734 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 ABCD1P33897 745 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 EMC2Q15006 297 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 CEP63Q96MT8 703 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 STRA6Q9BX79 667 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.89■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 GBF1Q92538 1859 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 EYSQ5T1H1 3165 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 A0A0C4DFX4 3053 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 K7ENM7 598 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 HBP1O60381 514 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 PPP1R37O75864 691 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 FGBP02675 491 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 SCP2P22307 547 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 KRT31Q15323 416 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 KAT2BQ92831 832 aa22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
DUSP28-201ENST00000343217 CEP89Q96ST8 783 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms