RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 CFAP73A6NFT4 308 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 F8W031 263 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CYP4A11Q02928 519 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 VPS72Q15906 364 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 DMAC2Q9NW81 257 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 FAM86B1E9PN63 330 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PPIP5K2O43314 1243 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 MGRN1O60291 552 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CTNNA2P26232 953 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 MDM1Q8TC05 714 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TEKT1Q969V4 418 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 THAP2Q9H0W7 228 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SNX24Q9Y343 169 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ALG6Q9Y672 507 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TLDC2A0PJX2 215 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 P4HA2O15460 535 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ATP5DP30049 168 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PTGIRP43119 386 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GPC5P78333 572 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GLG1Q92896 1179 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GMCL1Q96IK5 515 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GPR88Q9GZN0 384 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 AZI2Q9H6S1 392 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 NR2E1Q9Y466 385 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PASKQ96RG2 1323 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SHBGP04278 402 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RARGP13631 454 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ZNF131P52739 623 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 KCNA1Q09470 495 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 BFSP1Q12934 665 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SCLT1Q96NL6 688 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 NACC1Q96RE7 527 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PIK3CDO00329 1044 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 MTA2O94776 668 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CYP2J2P51589 502 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SLC29A2Q14542 456 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 MFSD5Q6N075 450 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SP8Q8IXZ3 490 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CCDC63Q8NA47 563 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ALG3Q92685 438 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PLVAPQ9BX97 442 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 DONSONQ9NYP3 566 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RPTORQ8N122 1335 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RASGRF2O14827 1237 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 EXOC3O60645 756 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ATP2C2O75185 946 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RTN2O75298 545 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ALAS1P13196 640 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ELF1P32519 619 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PDE6CP51160 858 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 PPP2R5CQ13362 524 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 RIPK1Q13546 671 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 ALCAMQ13740 583 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-201ENST00000313863 CYP1B1Q16678 543 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms