RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 DNM1LO00429 736 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 PDXKO00764 312 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 SCP2P22307 547 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 ZCWPW2Q504Y3 356 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 KCNN1Q92952 543 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 PHF24Q9UPV7 400 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.33■■□□□ 1.49
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CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PQY0 241 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 K7ERI5 159 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 GBP3Q9H0R5 595 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-201ENST00000312060 TGFB1I1O43294 461 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 POU5F1BQ06416 359 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 EFNA5P52803 228 aa24.31■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.31■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.31■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.31■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.31■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 A0A087WZ62 844 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 SGPL1O95470 568 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 PTENP60484 403 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CDC42EP1Q00587 391 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 STRN3Q13033 797 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 TAS1R3Q7RTX0 852 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.3■■□□□ 1.48
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CTU2-201ENST00000312060 PLCB2Q00722 1185 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 NLRP7Q8WX94 980 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 ZNF18P17022 549 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 PHKA2P46019 1235 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 PTGISQ16647 500 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 ZNF410Q86VK4 478 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 NME8Q8N427 588 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA5Q8TBA6 731 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 SCLT1Q96NL6 688 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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CTU2-201ENST00000312060 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 ADAM9Q13443 819 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 MAPK6Q16659 721 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 KIZQ2M2Z5 673 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 THAP9Q9H5L6 903 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 ATP1A3P13637 1013 aa24.27■■□□□ 1.48
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CTU2-201ENST00000312060 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 BICD1Q96G01 975 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 GPR32O75388 356 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 NR3C1P04150 777 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-201ENST00000312060 NOD1Q9Y239 953 aa24.27■■□□□ 1.48
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