RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-215	ENST00000626257	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	IVL	P07476	585 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRRC31	Q6UY01	552 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	DAAM2	Q86T65	1068 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CPXCR1	Q8N123	301 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRADD	Q15628	312 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	NIM1K	Q8IY84	436 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	RUFY1	Q96T51	708 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SAMM50	Q9Y512	469 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	ALAS1	P13196	640 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	KCNA3	P22001	575 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	RARRES1	P49788	294 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	LMO3	Q8TAP4	145 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZIM3	Q96PE6	472 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	TISP43	B9A030	160 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPFIA1	Q13136	1202 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMEM206	Q9H813	350 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	NCAN	O14594	1321 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC172	P0C7W6	258 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	KRT13	P13646	458 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	DPEP1	P16444	411 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	DLG4	P78352	724 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	GHRHR	Q02643	423 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMEM253	P0C7T8	217 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	GUCY2F	P51841	1108 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CXCL9	Q07325	125 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	MTMR1	Q13613	665 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	ALCAM	Q13740	583 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	MREG	Q8N565	214 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	RFFL	Q8WZ73	363 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	HES6	Q96HZ4	224 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	ACCS	Q96QU6	501 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLS3	P13797	630 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	SPP2	Q13103	211 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	DGKZ	Q13574	1117 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	LPAR1	Q92633	364 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	ARL8A	Q96BM9	186 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	EMSY	Q7Z589	1322 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CLSTN1	O94985	981 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	ABCB4	P21439	1286 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	RASA3	Q14644	834 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	TTMP	Q5BVD1	217 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	IQCK	Q8N0W5	287 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	WHAMM	Q8TF30	809 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	VPS33B	Q9H267	617 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CCZ1B-215	ENST00000626257	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	LRRN2	O75325	713 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	TNFAIP3	P21580	790 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	RFX1	P22670	979 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	KIF22	Q14807	665 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	AMFR	Q9UKV5	643 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	LYPLA2	O95372	231 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	VAMP7	P51809	220 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	CFAP58	Q5T655	872 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	ISCU	Q9H1K1	167 aa		28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
CCZ1B-215	ENST00000626257	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		28.57	■■■□□ 2.16

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