RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422		A0A087WZ62	844 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422		M0R296	226 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	EML1	O00423	815 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	DEXI	O95424	95 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	INF2	Q27J81	1249 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ANO5	Q75V66	913 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	LPP	Q93052	612 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	VAV3	Q9UKW4	847 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	CPLX1	O14810	134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	B4GALT3	O60512	393 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	PHKA2	P46019	1235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	BCAR1	P56945	870 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ZXDA	P98168	799 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	EOMES	O95936	686 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	MRE11	P49959	708 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	NPEPPS	P55786	919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	KRT17	Q04695	432 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	SCRN1	Q12765	414 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	IER5L	Q5T953	404 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CTIF-208	ENST00000590422	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PSMC5	P62195	406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CTIF-208	ENST00000590422	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms