RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533096.5

COPB1-209, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 1, humanhuman

TSL 4

Gene COPB1, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1-209ENST00000533096 ZNF862O60290 1169 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 OATP04181 439 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 KLRC2P26717 231 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 CLCN5P51795 746 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 DRP2Q13474 957 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 MTERF2Q49AM1 385 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 FAM167AQ96KS9 214 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.71□□□□□ -0.05
COPB1-209ENST00000533096 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 KAT6AQ92794 2004 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 A0A087WZ62 844 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 TMEM150BA6NC51 233 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 WDR64B1ANS9 1081 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 GALTP07902 379 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 PHKA2P46019 1235 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 FOXK2Q01167 660 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 PRKCEQ02156 737 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 UGCGQ16739 394 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 MCTP2Q6DN12 878 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 IGSF21Q96ID5 467 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ZBP1Q9H171 429 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.7□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 C2CD2LO14523 706 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 GAS7O60861 476 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CTSAP10619 480 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CPA1P15085 419 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ID4P47928 161 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 DNM2P50570 870 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 TDGQ13569 410 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 KSR1Q8IVT5 923 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 RASEFQ8IZ41 740 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 SIX5Q8N196 739 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 USTQ9Y2C2 406 aa14.69□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ALDH2P05091 517 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 NPR3P17342 541 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 RFX1P22670 979 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 GNA11P29992 359 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 GIT2Q14161 759 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 GPR149Q86SP6 731 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 PHKBQ93100 1093 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 KCNK12Q9HB15 430 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CHST12Q9NRB3 414 aa14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 TRIOO75962 3097 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 MSH4O15457 936 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 OFD1O75665 1012 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CFHP08603 1231 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 SLC11A1P49279 550 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ANGPT1Q15389 498 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 NLRP4Q96MN2 994 aa14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms