RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 C16orf92Q96LL3 132 aa7.29□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 PRRX2Q99811 253 aa7.29□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 TOX4O94842 621 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 MFSD5Q6N075 450 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ZNF627Q7L945 461 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 GPR87Q9BY21 358 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 DNAI1Q9UI46 699 aa7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 TRAF5O00463 557 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MAFGO15525 162 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 DAPK3O43293 454 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 FLT3P36888 993 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A3Q00325 362 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ZNF460Q14592 562 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.27□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PTGS2P35354 604 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ADCY1Q08828 1119 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MYBPC3Q14896 1274 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 NFE2L2Q16236 605 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ULK2Q8IYT8 1036 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 C7orf31Q8N865 590 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 B4GALT6Q9UBX8 382 aa7.26□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 RAMP2O60895 175 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MFAP3LO75121 409 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ARL8AQ96BM9 186 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 CBX4O00257 560 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 RPS6KA4O75676 772 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 JMJD7P0C870 316 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 SLC9A1P19634 815 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 RABGGTBP53611 331 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ADCY2Q08462 1091 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MB21D1Q8N884 522 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 NCDNQ9UBB6 729 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 XDHP47989 1333 aa7.24□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 KIR2DL3P43628 341 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 NPEPPSP55786 919 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MTG2Q9H4K7 406 aa7.23□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 A0A0A6YYJ9 748 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MTSS1O43312 755 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 FAM20BO75063 409 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 APOL3O95236 402 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 SQSTM1Q13501 440 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 SPIDRQ14159 915 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MAN2A1Q16706 1144 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 RABL3Q5HYI8 236 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PCSK4Q6UW60 755 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 HTR3DQ70Z44 454 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 HAS1Q92839 578 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 ZG16BQ96DA0 208 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PGBD4Q96DM1 585 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 AGAP2Q99490 1192 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 MNTQ99583 582 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 TTPALQ9BTX7 342 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.22□□□□□ -1.25
SGCE-211ENST00000522045 PPFIA2O75334 1257 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 FSBPO95073 299 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 KRT4P19013 534 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 GNAT2P19087 354 aa7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.21□□□□□ -1.26
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