RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 GPRC5CQ9NQ84 441 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 AKT3Q9Y243 479 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 CYP2C18P33260 490 aa22.21■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 RSPH3Q86UC2 560 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 SERINC5Q86VE9 423 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 IFT74Q96LB3 600 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 PANK4Q9NVE7 773 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.21■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 EYSQ5T1H1 3165 aa22.2■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 RSPH10BP0C881 870 aa22.2■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 UNC13DQ70J99 1090 aa22.2■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 TMEM240Q5SV17 173 aa22.19■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.19■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 MYCT1Q8N699 235 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 EXOC1Q9NV70 894 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 RMND1Q9NWS8 449 aa22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.19■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 ACRP10323 421 aa22.18■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.18■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 IL23AQ9NPF7 189 aa22.18■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.18■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.18■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 MYO9BQ13459 2157 aa22.17■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 M0QZ92 97 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 VTNP04004 478 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF131P52739 623 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 PEX3P56589 373 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 CDC42EP1Q00587 391 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.17■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 ODR4Q5SWX8 454 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.17■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.17■■□□□ 1.14
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SMIM20-201ENST00000506197 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC169A6NNP5 214 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 KLRC4O43908 158 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 GLRA2P23416 452 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 THPOP40225 353 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 NAMPTP43490 491 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 SMTNP53814 917 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 CCL23P55773 120 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF365Q70YC5 407 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 SFR1Q86XK3 245 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 NLRP4Q96MN2 994 aa22.16■■□□□ 1.14
SMIM20-201ENST00000506197 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.16■■□□□ 1.14
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