RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	EFCAB14	O75071	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ABHD16A	O95870	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNA6	P17658	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	IRF9	Q00978	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	PTPA	Q15257	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	KRT40	Q6A162	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	FOXB1	Q99853	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	MASP2	O00187	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	KRT37	O76014	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	TOX4	O94842	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	APP	P05067	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	DGKD	Q16760	1214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	MFAP3L	O75121	409 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	STC2	O76061	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	PRL	P01236	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ITGB1	P05556	798 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	HK1	P19367	917 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ROM1	Q03395	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	C21orf58	P58505	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCNL1-223	ENST00000481173		M0R2C6	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNQ2	O43526	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	B3GALT2	O43825	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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