RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 USP40Q9NVE5 1235 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 FLT1P17948 1338 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 NPATQ14207 1427 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 NSD2O96028 1365 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 VWA5AO00534 786 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 NDUFAB1O14561 156 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TRPA1O75762 1119 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 POU2F2P09086 479 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 RSPH10BP0C881 870 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CDH3P22223 829 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 PRKAR2BP31323 418 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ABCG1P45844 678 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 NR5A1Q13285 461 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 NFE2L1Q14494 772 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TAF12Q16514 161 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CFAP100Q494V2 611 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CEP97Q8IW35 865 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TTC13Q8NBP0 860 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 NCLNQ969V3 563 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 STK31Q9BXU1 1019 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CDC23Q9UJX2 597 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 C3P01024 1663 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 NCOA1Q15788 1441 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 A0A1B0GUL7 405 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 KRT87PA6NCN2 255 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 A6NLC8 198 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 K7EPI3 171 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 MEN1O00255 615 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 EXTL3O43909 919 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 OPA1O60313 960 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 AOC2O75106 756 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 KCNH1O95259 989 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 LARGE1O95461 756 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 HEXBP07686 556 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SCG2P13521 617 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CSF2RAP15509 400 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 KELP23276 732 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CBX1P83916 185 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 GUCY1B3Q02153 619 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 MBTPS1Q14703 1052 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 OLFM4Q6UX06 510 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 IFNL1Q8IU54 200 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 WHAMMQ8TF30 809 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SDCCAG3Q96C92 435 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 MED16Q9Y2X0 877 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 DOK2O60496 412 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SMPD2O60906 423 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 POLBP06746 335 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 COL6A2P12110 1019 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ATP5JP18859 108 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 GDI1P31150 447 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 ETV3P41162 512 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 HNMTP50135 292 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 TNFAIP2Q03169 654 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 FUT2Q10981 343 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 SLC14A1Q13336 389 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3-202ENST00000327307 CUL4BQ13620 913 aa7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms