RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM206Q9H813 350 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MYADML2A6NDP7 307 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ZEB2O60315 1214 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 INHAP05111 366 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KSR1Q8IVT5 923 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL13Q8N6R0 699 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 HVCN1Q96D96 273 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SCP2P22307 547 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRC1P26715 233 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 DNM2P50570 870 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF75DP51815 510 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP4BP1P59074 171 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 DRP2Q13474 957 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ACCSQ96QU6 501 aa22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EVPLQ92817 2033 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 NRCAMQ92823 1304 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 DENND3A2RUS2 1198 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNJ18B7U540 433 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 HAS3O00219 553 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS4O75173 837 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PSEN2P49810 448 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNJ12Q14500 433 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 DEPTORQ8TB45 409 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 GBP3Q9H0R5 595 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 IFNKQ9P0W0 207 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.79■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MSCO60682 206 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TBX20Q9UMR3 447 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TGFB1I1O43294 461 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CBFA2T2O43439 604 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TMOD1P28289 359 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 UBASH3AP57075 661 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CAPSQ13938 189 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP63Q96MT8 703 aa22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TPM3P06753 285 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 NR2F2P24468 414 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 CLCN3P51790 818 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNN1Q92952 543 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SETD4Q9NVD3 440 aa22.77■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SIP14410 1827 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 NR3C1P04150 777 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM9Q13443 819 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.76■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 CETN3O15182 167 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 TFDP1Q14186 410 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT31Q15323 416 aa22.75■■□□□ 1.23
PACSIN3-201ENST00000298838 NFIL3Q16649 462 aa22.75■■□□□ 1.23
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