RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 KIF28PB7ZC32 967 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM270Q6UE05 265 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PAMP19021 973 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 MYBL1P10243 752 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PMLP29590 882 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 USP11P51784 963 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 OCRLQ01968 901 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FAM47EQ6ZV65 393 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NUP85Q9BW27 656 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CPDO75976 1380 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SNAP23O00161 211 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 INPP1P49441 399 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PDXDC1Q6P996 788 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 RFFLQ8WZ73 363 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.57■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 STXBP2Q15833 593 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 E2F4Q16254 413 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PODNQ7Z5L7 613 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf38Q8TB03 319 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NCK2O43639 380 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF699Q32M78 642 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 KIF2CQ99661 725 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM260Q9NX78 707 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 KPNA7A9QM74 516 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SLC12A1Q13621 1099 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF394Q53GI3 561 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NRBF2Q96F24 287 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM15Q9C019 465 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 STOML1Q9UBI4 398 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 Q3C1V9 767 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.56■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A4O15374 487 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 KRT7P08729 469 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA13P27216 316 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC3O15438 1527 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ESYT3A0FGR9 886 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 BRAFP15056 766 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 INTUQ9ULD6 942 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 DENND3A2RUS2 1198 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 POTEFA5A3E0 1075 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 POTEIP0CG38 1075 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GPR162Q16538 588 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 POTEGQ6S5H5 508 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 UBE4BO95155 1302 aa22.55■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PP2D1A8MPX8 630 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP14Q86W24 1093 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GIPC2Q8TF65 315 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CENPKQ9BS16 269 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 F8W8V4 182 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FOXN1O15353 648 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms