RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 RALAP11233 206 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NFKBIAP25963 317 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SULT1E1P49888 294 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFAIP2Q03169 654 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP2R3CQ969Q6 453 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAM22Q9P0K1 906 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB5O15062 677 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MAFGO15525 162 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SLFN12LQ6IEE8 588 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SAYSD1Q9NPB0 183 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SUPT3HB4E1H0 165 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RFX8Q6ZV50 586 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CYB5R4Q7L1T6 521 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 EFHBQ8N7U6 833 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC26A7Q8TE54 656 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAIPQ9BWF2 469 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC13A1Q9BZW2 595 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP3K13O43283 966 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NFIXQ14938 502 aa12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCC12Q96J65 1359 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PP2D1A8MPX8 630 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF235Q14590 738 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DDIASQ8IXT1 998 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 STRIP2Q9ULQ0 834 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 F5H6K3 240 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 KLRC3Q07444 240 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SDE2Q6IQ49 451 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC71Q8N4P6 559 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM11Q96F44 468 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DCUN1D1Q96GG9 259 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PAGE5Q96GU1 130 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 LXNQ9BS40 222 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 IL9RQ01113 521 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SNAPC2Q13487 334 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NUP160Q12769 1436 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 E2F6O75461 281 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 DPEP1P16444 411 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ERFP50548 548 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC74AQ0VAA2 488 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NUDT18Q6ZVK8 323 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CERKQ8TCT0 537 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 EPS15L1Q9UBC2 864 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SPAG7O75391 227 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 STMN1P16949 149 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 GNASQ5JWF2 1037 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ACAP3Q96P50 834 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM39BQ9GZU3 492 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NARFQ9UHQ1 456 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 INSRP06213 1382 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 NLRP1Q9C000 1473 aa12.66□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 GNA15P30679 374 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ACOT2P49753 483 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MAN2A1Q16706 1144 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 OXER1Q8TDS5 423 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS6KA5O75582 802 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 THPOP40225 353 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PRAMEP78395 509 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 LMNB2Q03252 620 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SURF1Q15526 300 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC25A41Q8N5S1 370 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ROBO2Q9HCK4 1378 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SPDYE5A6NIY4 337 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 YY1P25490 414 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SPDYE7PQ495Y7 208 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CAPS2Q9BXY5 557 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 TEKT2Q9UIF3 430 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 KLF15Q9UIH9 416 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 SPDYAQ5MJ70 313 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CPDO75976 1380 aa12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
UBASH3B-201ENST00000284273 RCSD1Q6JBY9 416 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms