RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, human

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USF2-215	ENST00000602164	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.24	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.24	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.24	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.23	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.23	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.22	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.22	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		41.21	■■■■■ 4.19
USF2-215	ENST00000602164	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		41.18	■■■■■ 4.18
USF2-215	ENST00000602164	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.17	■■■■■ 4.18
USF2-215	ENST00000602164	ZMYM3	Q14202	1370 aa		41.16	■■■■■ 4.18
USF2-215	ENST00000602164	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		41.1	■■■■■ 4.17
USF2-215	ENST00000602164	DEPDC5	O75140	1603 aa		41.09	■■■■■ 4.17
USF2-215	ENST00000602164	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	41.08	■■■■■ 4.17
USF2-215	ENST00000602164	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.07	■■■■■ 4.16
USF2-215	ENST00000602164	NPAT	Q14207	1427 aa		41.07	■■■■■ 4.16
USF2-215	ENST00000602164	ABCC3	O15438	1527 aa		41.06	■■■■■ 4.16
USF2-215	ENST00000602164	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	41.06	■■■■■ 4.16
USF2-215	ENST00000602164	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
USF2-215	ENST00000602164	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.01	■■■■■ 4.16
USF2-215	ENST00000602164	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.99	■■■■■ 4.15
USF2-215	ENST00000602164	PZP	P20742	1482 aa		40.97	■■■■■ 4.15
USF2-215	ENST00000602164	CEP152	O94986	1710 aa		40.97	■■■■■ 4.15
USF2-215	ENST00000602164	ITGAE	P38570	1179 aa		40.97	■■■■■ 4.15
USF2-215	ENST00000602164	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.95	■■■■■ 4.15
USF2-215	ENST00000602164	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.94	■■■■■ 4.14
USF2-215	ENST00000602164	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.91	■■■■■ 4.14
USF2-215	ENST00000602164	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.88	■■■■■ 4.13
USF2-215	ENST00000602164	HSPA2	P54652	639 aa		40.87	■■■■■ 4.13
USF2-215	ENST00000602164	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.85	■■■■■ 4.13
USF2-215	ENST00000602164	UNC13B	O14795	1591 aa		40.83	■■■■■ 4.13
USF2-215	ENST00000602164	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
USF2-215	ENST00000602164	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
USF2-215	ENST00000602164	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.82	■■■■■ 4.13	1e-6	■■□□□ 14.5
USF2-215	ENST00000602164	KANK1	Q14678	1352 aa		40.81	■■■■■ 4.12
USF2-215	ENST00000602164	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.8	■■■■■ 4.12
USF2-215	ENST00000602164	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.78	■■■■■ 4.12
USF2-215	ENST00000602164	TNR	Q92752	1358 aa		40.77	■■■■■ 4.12
USF2-215	ENST00000602164	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
USF2-215	ENST00000602164	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.76	■■■■■ 4.12
USF2-215	ENST00000602164	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.73	■■■■■ 4.11
USF2-215	ENST00000602164	NAIP	Q13075	1403 aa		40.72	■■■■■ 4.11
USF2-215	ENST00000602164	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.72	■■■■■ 4.11
USF2-215	ENST00000602164	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.69	■■■■■ 4.1
USF2-215	ENST00000602164	HFM1	A2PYH4	1435 aa		40.67	■■■■■ 4.1
USF2-215	ENST00000602164	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.65	■■■■■ 4.1
USF2-215	ENST00000602164	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.64	■■■■■ 4.1
USF2-215	ENST00000602164	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.64	■■■■■ 4.1
USF2-215	ENST00000602164	TET3	O43151	1660 aa		40.64	■■■■■ 4.1
USF2-215	ENST00000602164	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
USF2-215	ENST00000602164	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.55	■■■■■ 4.08
USF2-215	ENST00000602164	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
USF2-215	ENST00000602164	NOS1	P29475	1434 aa		40.53	■■■■■ 4.08
USF2-215	ENST00000602164	NUP155	O75694	1391 aa		40.53	■■■■■ 4.08
USF2-215	ENST00000602164	SYNM	O15061	1565 aa		40.52	■■■■■ 4.08
USF2-215	ENST00000602164	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.49	■■■■■ 4.07
USF2-215	ENST00000602164		E9PCH4	1651 aa		40.49	■■■■■ 4.07
USF2-215	ENST00000602164	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.43	■■■■■ 4.06
USF2-215	ENST00000602164	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.4	■■■■■ 4.06
USF2-215	ENST00000602164	PTPRT	O14522	1441 aa		40.39	■■■■■ 4.06
USF2-215	ENST00000602164	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.36	■■■■■ 4.05
USF2-215	ENST00000602164	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
USF2-215	ENST00000602164	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.34	■■■■■ 4.05
USF2-215	ENST00000602164	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
USF2-215	ENST00000602164	PKD2	Q13563	968 aa		40.33	■■■■■ 4.05
USF2-215	ENST00000602164	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
USF2-215	ENST00000602164	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.32	■■■■■ 4.05
USF2-215	ENST00000602164	IDI1	Q13907	227 aa		40.31	■■■■■ 4.04
USF2-215	ENST00000602164	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.26	■■■■■ 4.04
USF2-215	ENST00000602164	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.26	■■■■■ 4.04
USF2-215	ENST00000602164	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.26	■■■■■ 4.04
USF2-215	ENST00000602164	SLIT1	O75093	1534 aa		40.26	■■■■■ 4.03
USF2-215	ENST00000602164	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.24	■■■■■ 4.03
USF2-215	ENST00000602164	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.22	■■■■■ 4.03
USF2-215	ENST00000602164	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.21	■■■■■ 4.03
USF2-215	ENST00000602164	MED14	O60244	1454 aa		40.2	■■■■■ 4.03
USF2-215	ENST00000602164	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.19	■■■■■ 4.02
USF2-215	ENST00000602164	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		40.16	■■■■■ 4.02
USF2-215	ENST00000602164	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.15	■■■■■ 4.02
USF2-215	ENST00000602164	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		40.12	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	TRPM2	O94759	1503 aa		40.11	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.11	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.11	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.11	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.09	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.09	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	LTK	P29376	864 aa		40.08	■■■■■ 4.01
USF2-215	ENST00000602164	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.06	■■■■■ 4
USF2-215	ENST00000602164	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.05	■■■■■ 4
USF2-215	ENST00000602164	ZFYVE9	O95405	1425 aa		40.02	■■■■■ 4
USF2-215	ENST00000602164	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.02	■■■■■ 4
USF2-215	ENST00000602164	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.02	■■■■■ 4
USF2-215	ENST00000602164	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		39.98	■■■■□ 3.99
USF2-215	ENST00000602164	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
USF2-215	ENST00000602164	EID1	Q9Y6B2	187 aa		39.97	■■■■□ 3.99
USF2-215	ENST00000602164	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		39.94	■■■■□ 3.98
USF2-215	ENST00000602164	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	39.92	■■■■□ 3.98
USF2-215	ENST00000602164	FOXD1	Q16676	465 aa		39.92	■■■■□ 3.98
USF2-215	ENST00000602164	CERK	Q8TCT0	537 aa		39.91	■■■■□ 3.98

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