RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587016.5

HDGFL2-201, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

TSL 3

Gene HDGFL2, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-201ENST00000587016 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
HDGFL2-201ENST00000587016 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.54■■■□□ 2.16
HDGFL2-201ENST00000587016 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.53■■■□□ 2.16
HDGFL2-201ENST00000587016 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.53■■■□□ 2.16
HDGFL2-201ENST00000587016 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.52■■■□□ 2.16
HDGFL2-201ENST00000587016 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.51■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 C3P01024 1663 aa28.51■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 MLECQ14165 292 aa28.5■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.49■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.49■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 KIF3BO15066 747 aa28.48■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 UNC13BO14795 1591 aa28.47■■■□□ 2.15
HDGFL2-201ENST00000587016 ABCC3O15438 1527 aa28.44■■■□□ 2.14
HDGFL2-201ENST00000587016 HFM1A2PYH4 1435 aa28.43■■■□□ 2.14
HDGFL2-201ENST00000587016 NAIPQ13075 1403 aa28.43■■■□□ 2.14
HDGFL2-201ENST00000587016 CEP152O94986 1710 aa28.42■■■□□ 2.14
HDGFL2-201ENST00000587016 GGT6Q6P531 493 aa28.41■■■□□ 2.14
HDGFL2-201ENST00000587016 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.41■■■□□ 2.14
HDGFL2-201ENST00000587016 ITGAEP38570 1179 aa28.38■■■□□ 2.13
HDGFL2-201ENST00000587016 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.38■■■□□ 2.13
HDGFL2-201ENST00000587016 ZMYM3Q14202 1370 aa28.35■■■□□ 2.13
HDGFL2-201ENST00000587016 PZPP20742 1482 aa28.34■■■□□ 2.13
HDGFL2-201ENST00000587016 NPATQ14207 1427 aa28.34■■■□□ 2.13
HDGFL2-201ENST00000587016 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.33■■■□□ 2.13
HDGFL2-201ENST00000587016 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.31■■■□□ 2.12
HDGFL2-201ENST00000587016 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.3■■■□□ 2.12
HDGFL2-201ENST00000587016 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HDGFL2-201ENST00000587016 TET3O43151 1660 aa28.29■■■□□ 2.12
HDGFL2-201ENST00000587016 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.28■■■□□ 2.12
HDGFL2-201ENST00000587016 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.28■■■□□ 2.12
HDGFL2-201ENST00000587016 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.26■■■□□ 2.11
HDGFL2-201ENST00000587016 KANK1Q14678 1352 aa28.25■■■□□ 2.11
HDGFL2-201ENST00000587016 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HDGFL2-201ENST00000587016 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HDGFL2-201ENST00000587016 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.22■■■□□ 2.11
HDGFL2-201ENST00000587016 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.22■■■□□ 2.11
HDGFL2-201ENST00000587016 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
HDGFL2-201ENST00000587016 ERVK-7P63135 1459 aa28.19■■■□□ 2.1
HDGFL2-201ENST00000587016 E9PCH4 1651 aa28.17■■■□□ 2.1
HDGFL2-201ENST00000587016 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.13e-7■■■■□ 20.4
HDGFL2-201ENST00000587016 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.13■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.13■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 NUP155O75694 1391 aa28.11■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 NOS1P29475 1434 aa28.11■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 SYNMO15061 1565 aa28.1■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 TNRQ92752 1358 aa28.1■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 NLRP1Q9C000 1473 aa28.09■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HDGFL2-201ENST00000587016 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HDGFL2-201ENST00000587016 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.06■■■□□ 2.08
HDGFL2-201ENST00000587016 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
HDGFL2-201ENST00000587016 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.05■■■□□ 2.08
HDGFL2-201ENST00000587016 PIK3C2BO00750 1634 aa28.04■■■□□ 2.08
HDGFL2-201ENST00000587016 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.04■■■□□ 2.08
HDGFL2-201ENST00000587016 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.02■■■□□ 2.08
HDGFL2-201ENST00000587016 HRCP23327 699 aa28■■■□□ 2.07
HDGFL2-201ENST00000587016 PTPRTO14522 1441 aa27.99■■■□□ 2.07
HDGFL2-201ENST00000587016 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.98■■■□□ 2.07
HDGFL2-201ENST00000587016 PLA2R1Q13018 1463 aa27.95■■■□□ 2.07
HDGFL2-201ENST00000587016 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.94■■■□□ 2.06
HDGFL2-201ENST00000587016 TRPM2O94759 1503 aa27.94■■■□□ 2.06
HDGFL2-201ENST00000587016 STRCQ7RTU9 1775 aa27.94■■■□□ 2.06
HDGFL2-201ENST00000587016 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
HDGFL2-201ENST00000587016 ADGRB3O60242 1522 aa27.91■■■□□ 2.06
HDGFL2-201ENST00000587016 TRIM52Q96A61 297 aa27.88■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.87■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.87■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 SLIT1O75093 1534 aa27.86■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.85■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 HSPA2P54652 639 aa27.85■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 CLTCL1P53675 1640 aa27.85■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.83■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 PKD2Q13563 968 aa27.83■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 IDI1Q13907 227 aa27.83■■■□□ 2.05
HDGFL2-201ENST00000587016 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.82■■■□□ 2.04
HDGFL2-201ENST00000587016 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.81■■■□□ 2.04
HDGFL2-201ENST00000587016 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
HDGFL2-201ENST00000587016 KIF1BO60333 1816 aa27.76■■■□□ 2.03
HDGFL2-201ENST00000587016 MED14O60244 1454 aa27.76■■■□□ 2.03
HDGFL2-201ENST00000587016 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.73■■■□□ 2.03
HDGFL2-201ENST00000587016 ZFYVE9O95405 1425 aa27.72■■■□□ 2.03
HDGFL2-201ENST00000587016 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
HDGFL2-201ENST00000587016 IQGAP1P46940 1657 aa27.67■■■□□ 2.02
HDGFL2-201ENST00000587016 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.66■■■□□ 2.02
HDGFL2-201ENST00000587016 FOXD1Q16676 465 aa27.66■■■□□ 2.02
HDGFL2-201ENST00000587016 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
HDGFL2-201ENST00000587016 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.64■■■□□ 2.02
HDGFL2-201ENST00000587016 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.62■■■□□ 2.01
HDGFL2-201ENST00000587016 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.62■■■□□ 2.01
HDGFL2-201ENST00000587016 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.62■■■□□ 2.01
HDGFL2-201ENST00000587016 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.62■■■□□ 2.01
HDGFL2-201ENST00000587016 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.61■■■□□ 2.01
HDGFL2-201ENST00000587016 IFT172Q9UG01 1749 aa27.61■■■□□ 2.01
HDGFL2-201ENST00000587016 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms