RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.7	■■■□□ 2.99
GPS1-222	ENST00000583983	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-222	ENST00000583983	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.69	■■■□□ 2.98
GPS1-222	ENST00000583983	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-222	ENST00000583983	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.66	■■■□□ 2.98
GPS1-222	ENST00000583983	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
GPS1-222	ENST00000583983	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
GPS1-222	ENST00000583983	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GPS1-222	ENST00000583983	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GPS1-222	ENST00000583983	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.61	■■■□□ 2.97
GPS1-222	ENST00000583983	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GPS1-222	ENST00000583983	ITGAE	P38570	1179 aa		33.58	■■■□□ 2.97
GPS1-222	ENST00000583983	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.57	■■■□□ 2.97
GPS1-222	ENST00000583983	NPAT	Q14207	1427 aa		33.56	■■■□□ 2.96
GPS1-222	ENST00000583983	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
GPS1-222	ENST00000583983	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GPS1-222	ENST00000583983	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.54	■■■□□ 2.96
GPS1-222	ENST00000583983	ABCC3	O15438	1527 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	HSPA2	P54652	639 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	PZP	P20742	1482 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.46	■■■□□ 2.95
GPS1-222	ENST00000583983	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
GPS1-222	ENST00000583983	CEP152	O94986	1710 aa		33.42	■■■□□ 2.94
GPS1-222	ENST00000583983	KANK1	Q14678	1352 aa		33.41	■■■□□ 2.94
GPS1-222	ENST00000583983	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.38	■■■□□ 2.93
GPS1-222	ENST00000583983	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.37	■■■□□ 2.93
GPS1-222	ENST00000583983	TNR	Q92752	1358 aa		33.35	■■■□□ 2.93
GPS1-222	ENST00000583983	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.34	■■■□□ 2.93
GPS1-222	ENST00000583983	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-222	ENST00000583983	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GPS1-222	ENST00000583983	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GPS1-222	ENST00000583983	UNC13B	O14795	1591 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GPS1-222	ENST00000583983	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.28	■■■□□ 2.92
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
GPS1-222	ENST00000583983	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
GPS1-222	ENST00000583983	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-222	ENST00000583983	NAIP	Q13075	1403 aa		33.25	■■■□□ 2.91
GPS1-222	ENST00000583983	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-222	ENST00000583983	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.21	■■■□□ 2.91
GPS1-222	ENST00000583983	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-222	ENST00000583983	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GPS1-222	ENST00000583983	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GPS1-222	ENST00000583983	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GPS1-222	ENST00000583983	NUP155	O75694	1391 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GPS1-222	ENST00000583983	TET3	O43151	1660 aa		33.15	■■■□□ 2.9
GPS1-222	ENST00000583983	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.14	■■■□□ 2.9
GPS1-222	ENST00000583983	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.12	■■■□□ 2.89
GPS1-222	ENST00000583983	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
GPS1-222	ENST00000583983	NOS1	P29475	1434 aa		33.1	■■■□□ 2.89
GPS1-222	ENST00000583983	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GPS1-222	ENST00000583983	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.09	■■■□□ 2.89
GPS1-222	ENST00000583983	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
GPS1-222	ENST00000583983	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.05	■■■□□ 2.88
GPS1-222	ENST00000583983	SYNM	O15061	1565 aa		33.04	■■■□□ 2.88
GPS1-222	ENST00000583983	PKD2	Q13563	968 aa		33.03	■■■□□ 2.88
GPS1-222	ENST00000583983	PTPRT	O14522	1441 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-222	ENST00000583983		E9PCH4	1651 aa		33.02	■■■□□ 2.88
GPS1-222	ENST00000583983	IDI1	Q13907	227 aa		33	■■■□□ 2.87
GPS1-222	ENST00000583983	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.98	■■■□□ 2.87
GPS1-222	ENST00000583983	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-222	ENST00000583983	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-222	ENST00000583983	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.97	■■■□□ 2.87
GPS1-222	ENST00000583983	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.94	■■■□□ 2.86
GPS1-222	ENST00000583983	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.91	■■■□□ 2.86
GPS1-222	ENST00000583983	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.9	■■■□□ 2.86
GPS1-222	ENST00000583983	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
GPS1-222	ENST00000583983	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.88	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	SLIT1	O75093	1534 aa		32.87	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.86	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	MED14	O60244	1454 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GPS1-222	ENST00000583983	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	LTK	P29376	864 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.78	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.77	■■■□□ 2.84
GPS1-222	ENST00000583983	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	TRPM2	O94759	1503 aa		32.72	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.71	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.71	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.71	■■■□□ 2.83
GPS1-222	ENST00000583983	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.68	■■■□□ 2.82
GPS1-222	ENST00000583983	FOXD1	Q16676	465 aa		32.67	■■■□□ 2.82
GPS1-222	ENST00000583983	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.66	■■■□□ 2.82
GPS1-222	ENST00000583983	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.66	■■■□□ 2.82

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