RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 KIF3BO15066 747 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRM-210ENST00000578916 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 MBD5Q9P267 1494 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 PZPP20742 1482 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 MIA2Q96PC5 1412 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 NLRP1Q9C000 1473 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 TIAM1Q13009 1591 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRM-210ENST00000578916 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 MED14O60244 1454 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 CEP162Q5TB80 1403 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 TSPY4P0CV99 314 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 TSPY10P0CW01 314 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 DEPDC5O75140 1603 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 ALKQ9UM73 1620 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRM-210ENST00000578916 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRM-210ENST00000578916 IQGAP1P46940 1657 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRM-210ENST00000578916 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRM-210ENST00000578916 NCOA2Q15596 1464 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRM-210ENST00000578916 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRM-210ENST00000578916 SYNMO15061 1565 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRM-210ENST00000578916 ERVK-7P63135 1459 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 ABCC3O15438 1527 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 LTKP29376 864 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 EID1Q9Y6B2 187 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRM-210ENST00000578916 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 POTEAQ6S8J7 498 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTPRM-210ENST00000578916 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 SLIT1O75093 1534 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM94Q12767 1356 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRM-210ENST00000578916 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 KCNA6P17658 529 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
PTPRM-210ENST00000578916 CEP152O94986 1710 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 KIF15Q9NS87 1388 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 IDI1Q13907 227 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 BCANQ96GW7 911 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 KANK1Q14678 1352 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 PIK3C2BO00750 1634 aa14.41□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 ERBINQ96RT1 1412 aa14.41□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.4□□□□□ -0.1
PTPRM-210ENST00000578916 MSH6P52701 1360 aa14.4□□□□□ -0.1
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PTPRM-210ENST00000578916 SLAIN2Q9P270 581 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 MAP3K1Q13233 1512 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 JCADQ9P266 1359 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 TET3O43151 1660 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 ABCC5O15440 1437 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 SLC24A1O60721 1099 aa14.36□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRM-210ENST00000578916 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.33□□□□□ -0.12
PTPRM-210ENST00000578916 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRM-210ENST00000578916 NWD1Q149M9 1564 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRM-210ENST00000578916 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
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