RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572560.1

AKAP1-209, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP1, Length 442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-209ENST00000572560 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.42■■□□□ 1.66
AKAP1-209ENST00000572560 TNRQ92752 1358 aa25.42■■□□□ 1.66
AKAP1-209ENST00000572560 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
AKAP1-209ENST00000572560 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.41■■□□□ 1.66
AKAP1-209ENST00000572560 CPS1P31327 1500 aa25.41■■□□□ 1.66
AKAP1-209ENST00000572560 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
AKAP1-209ENST00000572560 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
AKAP1-209ENST00000572560 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
AKAP1-209ENST00000572560 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.36■■□□□ 1.65
AKAP1-209ENST00000572560 MBD5Q9P267 1494 aa25.34■■□□□ 1.65
AKAP1-209ENST00000572560 TSPY4P0CV99 314 aa25.32■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 TSPY10P0CW01 314 aa25.32■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 PZPP20742 1482 aa25.31■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.31■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 MIA2Q96PC5 1412 aa25.3■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.29■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 CEP162Q5TB80 1403 aa25.29■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 NLRP1Q9C000 1473 aa25.28■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.27■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.27■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 TIAM1Q13009 1591 aa25.27■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
AKAP1-209ENST00000572560 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
AKAP1-209ENST00000572560 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
AKAP1-209ENST00000572560 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.24■■□□□ 1.63
AKAP1-209ENST00000572560 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.22■■□□□ 1.63
AKAP1-209ENST00000572560 MED14O60244 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
AKAP1-209ENST00000572560 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.16■■□□□ 1.62
AKAP1-209ENST00000572560 DEPDC5O75140 1603 aa25.16■■□□□ 1.62
AKAP1-209ENST00000572560 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.16■■□□□ 1.62
AKAP1-209ENST00000572560 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
AKAP1-209ENST00000572560 NCOA2Q15596 1464 aa25.14■■□□□ 1.61
AKAP1-209ENST00000572560 IQGAP1P46940 1657 aa25.09■■□□□ 1.61
AKAP1-209ENST00000572560 EID1Q9Y6B2 187 aa25.08■■□□□ 1.61
AKAP1-209ENST00000572560 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.07■■□□□ 1.6
AKAP1-209ENST00000572560 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.06■■□□□ 1.6
AKAP1-209ENST00000572560 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.05■■□□□ 1.6
AKAP1-209ENST00000572560 ERVK-7P63135 1459 aa25.02■■□□□ 1.6
AKAP1-209ENST00000572560 ABCC3O15438 1527 aa25.02■■□□□ 1.6
AKAP1-209ENST00000572560 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.01■■□□□ 1.59
AKAP1-209ENST00000572560 SYNMO15061 1565 aa25.01■■□□□ 1.59
AKAP1-209ENST00000572560 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
AKAP1-209ENST00000572560 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
AKAP1-209ENST00000572560 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
AKAP1-209ENST00000572560 ALKQ9UM73 1620 aa25■■□□□ 1.59
AKAP1-209ENST00000572560 LTKP29376 864 aa24.95■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.93■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.91■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.91■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.9■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.9■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.9■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.89■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.584e-7■□□□□ 9.3
AKAP1-209ENST00000572560 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
AKAP1-209ENST00000572560 SLIT1O75093 1534 aa24.89■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 KANK1Q14678 1352 aa24.89■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.89■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.88■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.86■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 KCNA6P17658 529 aa24.86■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.85■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 KIF15Q9NS87 1388 aa24.84■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.83■■□□□ 1.57
AKAP1-209ENST00000572560 TMEM94Q12767 1356 aa24.82■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 BCANQ96GW7 911 aa24.82■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 CEP152O94986 1710 aa24.81■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 ERBINQ96RT1 1412 aa24.81■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.81■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 APLP2Q06481 763 aa24.8■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 IDI1Q13907 227 aa24.78■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.78■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 POTEAQ6S8J7 498 aa24.77■■□□□ 1.56
AKAP1-209ENST00000572560 MAP3K1Q13233 1512 aa24.76■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.74■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 MSH6P52701 1360 aa24.74■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.74■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 SLAIN2Q9P270 581 aa24.72■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 PIK3C2BO00750 1634 aa24.72■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 ABCC5O15440 1437 aa24.7■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.7■■□□□ 1.55
AKAP1-209ENST00000572560 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 JCADQ9P266 1359 aa24.67■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.66■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.66■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 DAPK1P53355 1430 aa24.65■■□□□ 1.54
AKAP1-209ENST00000572560 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.63■■□□□ 1.53
AKAP1-209ENST00000572560 C14orf37Q86TY3 774 aa24.63■■□□□ 1.53
AKAP1-209ENST00000572560 TET3O43151 1660 aa24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms