RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, human

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	KIF3B	O15066	747 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.77	■■■□□ 2.2
RABGGTA-208	ENST00000558954	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	GGT6	Q6P531	493 aa		28.75	■■■□□ 2.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	CEP152	O94986	1710 aa		28.74	■■■□□ 2.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	ITGAE	P38570	1179 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.73	■■■□□ 2.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
RABGGTA-208	ENST00000558954	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.69	■■■□□ 2.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.68	■■■□□ 2.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	ABCC3	O15438	1527 aa		28.66	■■■□□ 2.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	UNC13B	O14795	1591 aa		28.65	■■■□□ 2.18
RABGGTA-208	ENST00000558954	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.62	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.61	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.6	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	KANK1	Q14678	1352 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	NPAT	Q14207	1427 aa		28.58	■■■□□ 2.17
RABGGTA-208	ENST00000558954	PZP	P20742	1482 aa		28.57	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.54	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	NAIP	Q13075	1403 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	TET3	O43151	1660 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.53	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.52	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.16
RABGGTA-208	ENST00000558954	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.51	■■■□□ 2.15	4e-6	■■□□□ 14.1
RABGGTA-208	ENST00000558954	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.49	■■■□□ 2.15
RABGGTA-208	ENST00000558954	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.47	■■■□□ 2.15
RABGGTA-208	ENST00000558954	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.45	■■■□□ 2.15
RABGGTA-208	ENST00000558954	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.45	■■■□□ 2.15
RABGGTA-208	ENST00000558954	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.42	■■■□□ 2.14
RABGGTA-208	ENST00000558954	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
RABGGTA-208	ENST00000558954		E9PCH4	1651 aa		28.41	■■■□□ 2.14
RABGGTA-208	ENST00000558954	TNR	Q92752	1358 aa		28.39	■■■□□ 2.14
RABGGTA-208	ENST00000558954	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
RABGGTA-208	ENST00000558954	NUP155	O75694	1391 aa		28.37	■■■□□ 2.13
RABGGTA-208	ENST00000558954	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
RABGGTA-208	ENST00000558954	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.34	■■■□□ 2.13
RABGGTA-208	ENST00000558954	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.33	■■■□□ 2.13
RABGGTA-208	ENST00000558954	SYNM	O15061	1565 aa		28.3	■■■□□ 2.12
RABGGTA-208	ENST00000558954	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.29	■■■□□ 2.12
RABGGTA-208	ENST00000558954	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.28	■■■□□ 2.12
RABGGTA-208	ENST00000558954	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.27	■■■□□ 2.12
RABGGTA-208	ENST00000558954	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
RABGGTA-208	ENST00000558954	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.26	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	NOS1	P29475	1434 aa		28.26	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	HSPA2	P54652	639 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.25	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.24	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.21	■■■□□ 2.11
RABGGTA-208	ENST00000558954	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.2	■■■□□ 2.1
RABGGTA-208	ENST00000558954	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.19	■■■□□ 2.1
RABGGTA-208	ENST00000558954	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.18	■■■□□ 2.1
RABGGTA-208	ENST00000558954	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.15	■■■□□ 2.1
RABGGTA-208	ENST00000558954	TRPM2	O94759	1503 aa		28.12	■■■□□ 2.09
RABGGTA-208	ENST00000558954	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
RABGGTA-208	ENST00000558954	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.1	■■■□□ 2.09
RABGGTA-208	ENST00000558954	KIF1B	O60333	1816 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RABGGTA-208	ENST00000558954	PTPRT	O14522	1441 aa		28.09	■■■□□ 2.09
RABGGTA-208	ENST00000558954	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
RABGGTA-208	ENST00000558954	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.07	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	SLIT1	O75093	1534 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	PKD2	Q13563	968 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	IDI1	Q13907	227 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.05	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.03	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	HRC	P23327	699 aa		28.02	■■■□□ 2.08
RABGGTA-208	ENST00000558954	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.01	■■■□□ 2.07
RABGGTA-208	ENST00000558954	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
RABGGTA-208	ENST00000558954	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28	■■■□□ 2.07
RABGGTA-208	ENST00000558954	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28	■■■□□ 2.07
RABGGTA-208	ENST00000558954	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
RABGGTA-208	ENST00000558954	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RABGGTA-208	ENST00000558954	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.96	■■■□□ 2.07
RABGGTA-208	ENST00000558954	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RABGGTA-208	ENST00000558954	MED14	O60244	1454 aa		27.95	■■■□□ 2.06
RABGGTA-208	ENST00000558954	FOXD1	Q16676	465 aa		27.91	■■■□□ 2.06
RABGGTA-208	ENST00000558954	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RABGGTA-208	ENST00000558954	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
RABGGTA-208	ENST00000558954	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RABGGTA-208	ENST00000558954	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RABGGTA-208	ENST00000558954	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RABGGTA-208	ENST00000558954	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RABGGTA-208	ENST00000558954	PPL	O60437	1756 aa		27.84	■■■□□ 2.05

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