RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558180.2

IRX3-203, Transcript of iroquois homeobox 3, humanhuman

TSL 4

Gene IRX3, Length 1,540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3-203ENST00000558180 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.3■■■■■ 4.36
IRX3-203ENST00000558180 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
IRX3-203ENST00000558180 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.29■■■■■ 4.36
IRX3-203ENST00000558180 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.28■■■■■ 4.36
IRX3-203ENST00000558180 DEPDC5O75140 1603 aa42.27■■■■■ 4.36
IRX3-203ENST00000558180 PZPP20742 1482 aa42.26■■■■■ 4.36
IRX3-203ENST00000558180 AGLP35573 1532 aa42.25■■■■■ 4.35
IRX3-203ENST00000558180 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.25■■■■■ 4.35
IRX3-203ENST00000558180 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
IRX3-203ENST00000558180 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.21■■■■■ 4.35
IRX3-203ENST00000558180 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
IRX3-203ENST00000558180 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.21■■■■■ 4.35
IRX3-203ENST00000558180 GGT6Q6P531 493 aa42.2■■■■■ 4.35
IRX3-203ENST00000558180 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
IRX3-203ENST00000558180 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.17■■■■■ 4.34
IRX3-203ENST00000558180 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.17■■■■■ 4.34
IRX3-203ENST00000558180 KANK1Q14678 1352 aa42.16■■■■■ 4.34
IRX3-203ENST00000558180 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.14■■■■■ 4.34
IRX3-203ENST00000558180 PKD2Q13563 968 aa42.07■■■■■ 4.33
IRX3-203ENST00000558180 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.32
IRX3-203ENST00000558180 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.04■■■■■ 4.32
IRX3-203ENST00000558180 FOXD1Q16676 465 aa42.03■■■■■ 4.32
IRX3-203ENST00000558180 MLECQ14165 292 aa42.01■■■■■ 4.32
IRX3-203ENST00000558180 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.01■■■■■ 4.32
IRX3-203ENST00000558180 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42■■■■■ 4.31
IRX3-203ENST00000558180 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42■■■■■ 4.31
IRX3-203ENST00000558180 ABCC3O15438 1527 aa41.97■■■■■ 4.31
IRX3-203ENST00000558180 CEP152O94986 1710 aa41.95■■■■■ 4.31
IRX3-203ENST00000558180 TET3O43151 1660 aa41.95■■■■■ 4.31
IRX3-203ENST00000558180 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.9■■■■■ 4.3
IRX3-203ENST00000558180 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
IRX3-203ENST00000558180 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.87■■■■■ 4.29
IRX3-203ENST00000558180 E9PCH4 1651 aa41.86■■■■■ 4.29
IRX3-203ENST00000558180 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.82■■■■■ 4.29
IRX3-203ENST00000558180 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.82■■■■■ 4.29
IRX3-203ENST00000558180 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
IRX3-203ENST00000558180 NPATQ14207 1427 aa41.78■■■■■ 4.28
IRX3-203ENST00000558180 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.78■■■■■ 4.28
IRX3-203ENST00000558180 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
IRX3-203ENST00000558180 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
IRX3-203ENST00000558180 PLA2R1Q13018 1463 aa41.76■■■■■ 4.28
IRX3-203ENST00000558180 NEUROD1Q13562 356 aa41.72■■■■■ 4.27
IRX3-203ENST00000558180 PTPRTO14522 1441 aa41.72■■■■■ 4.27
IRX3-203ENST00000558180 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.7■■■■■ 4.27
IRX3-203ENST00000558180 ZMYM3Q14202 1370 aa41.66■■■■■ 4.26
IRX3-203ENST00000558180 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
IRX3-203ENST00000558180 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.64■■■■■ 4.26
IRX3-203ENST00000558180 TRPM2O94759 1503 aa41.62■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.61■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.6■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 NOS1P29475 1434 aa41.6■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 MROH2AA6NES4 1674 aa41.59■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.58■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
IRX3-203ENST00000558180 MADDQ8WXG6 1647 aa41.54■■■■■ 4.24
IRX3-203ENST00000558180 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.53■■■■■ 4.24
IRX3-203ENST00000558180 ERVK-7P63135 1459 aa41.53■■■■■ 4.24
IRX3-203ENST00000558180 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.49■■■■■ 4.23
IRX3-203ENST00000558180 CLTCL1P53675 1640 aa41.48■■■■■ 4.23
IRX3-203ENST00000558180 SYNMO15061 1565 aa41.48■■■■■ 4.23
IRX3-203ENST00000558180 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.47■■■■■ 4.23
IRX3-203ENST00000558180 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.47■■■■■ 4.23
IRX3-203ENST00000558180 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
IRX3-203ENST00000558180 TONSLQ96HA7 1378 aa41.45■■■■■ 4.23
IRX3-203ENST00000558180 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
IRX3-203ENST00000558180 C3P01024 1663 aa41.44■■■■■ 4.22
IRX3-203ENST00000558180 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.4■■■■■ 4.22
IRX3-203ENST00000558180 PIK3C2BO00750 1634 aa41.38■■■■■ 4.21
IRX3-203ENST00000558180 IDI1Q13907 227 aa41.37■■■■■ 4.21
IRX3-203ENST00000558180 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.36■■■■■ 4.21
IRX3-203ENST00000558180 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.35■■■■■ 4.21
IRX3-203ENST00000558180 TNRQ92752 1358 aa41.34■■■■■ 4.21
IRX3-203ENST00000558180 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.34■■■■■ 4.21
IRX3-203ENST00000558180 RGL3Q3MIN7 710 aa41.31■■■■■ 4.2
IRX3-203ENST00000558180 KIF1BO60333 1816 aa41.27■■■■■ 4.2
IRX3-203ENST00000558180 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.27■■■■■ 4.2
IRX3-203ENST00000558180 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
IRX3-203ENST00000558180 PTPRMP28827 1452 aa41.24■■■■■ 4.19
IRX3-203ENST00000558180 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
IRX3-203ENST00000558180 ADGRB3O60242 1522 aa41.23■■■■■ 4.19
IRX3-203ENST00000558180 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.21■■■■■ 4.19
IRX3-203ENST00000558180 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.18■■■■■ 4.18
IRX3-203ENST00000558180 NLRP1Q9C000 1473 aa41.16■■■■■ 4.18
IRX3-203ENST00000558180 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.16■■■■■ 4.18
IRX3-203ENST00000558180 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
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IRX3-203ENST00000558180 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.12■■■■■ 4.17
IRX3-203ENST00000558180 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.08■■■■■ 4.17
IRX3-203ENST00000558180 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.07■■■■■ 4.17
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IRX3-203ENST00000558180 STAC3Q96MF2 364 aa41.04■■■■■ 4.16
IRX3-203ENST00000558180 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.03■■■■■ 4.16
IRX3-203ENST00000558180 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.03■■■■■ 4.16
IRX3-203ENST00000558180 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
IRX3-203ENST00000558180 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.01■■■■■ 4.16
IRX3-203ENST00000558180 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
IRX3-203ENST00000558180 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.99■■■■■ 4.15
IRX3-203ENST00000558180 IFT172Q9UG01 1749 aa40.98■■■■■ 4.15
IRX3-203ENST00000558180 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.97■■■■■ 4.15
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