RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548421.2

BRF1-213, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BRF1, Length 1,452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-213ENST00000548421 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
BRF1-213ENST00000548421 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
BRF1-213ENST00000548421 KIF3BO15066 747 aa42.51■■■■■ 4.4
BRF1-213ENST00000548421 NUP155O75694 1391 aa42.48■■■■■ 4.39
BRF1-213ENST00000548421 AGLP35573 1532 aa42.47■■■■■ 4.39
BRF1-213ENST00000548421 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
BRF1-213ENST00000548421 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
BRF1-213ENST00000548421 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.46■■■■■ 4.39
BRF1-213ENST00000548421 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.46■■■■■ 4.39
BRF1-213ENST00000548421 PZPP20742 1482 aa42.45■■■■■ 4.39
BRF1-213ENST00000548421 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.44■■■■■ 4.38
BRF1-213ENST00000548421 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.41■■■■■ 4.38
BRF1-213ENST00000548421 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.41■■■■■ 4.38
BRF1-213ENST00000548421 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.38■■■■■ 4.38
BRF1-213ENST00000548421 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.37■■■■■ 4.37
BRF1-213ENST00000548421 KANK1Q14678 1352 aa42.36■■■■■ 4.37
BRF1-213ENST00000548421 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
BRF1-213ENST00000548421 GGT6Q6P531 493 aa42.3■■■■■ 4.36
BRF1-213ENST00000548421 CEP152O94986 1710 aa42.26■■■■■ 4.36
BRF1-213ENST00000548421 TET3O43151 1660 aa42.26■■■■■ 4.35
BRF1-213ENST00000548421 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.25■■■■■ 4.35
BRF1-213ENST00000548421 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
BRF1-213ENST00000548421 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.23■■■■■ 4.35
BRF1-213ENST00000548421 ABCC3O15438 1527 aa42.2■■■■■ 4.35
BRF1-213ENST00000548421 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
BRF1-213ENST00000548421 PKD2Q13563 968 aa42.19■■■■■ 4.34
BRF1-213ENST00000548421 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.15■■■■■ 4.34
BRF1-213ENST00000548421 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.15■■■■■ 4.34
BRF1-213ENST00000548421 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.14■■■■■ 4.34
BRF1-213ENST00000548421 E9PCH4 1651 aa42.14■■■■■ 4.34
BRF1-213ENST00000548421 FOXD1Q16676 465 aa42.12■■■■■ 4.33
BRF1-213ENST00000548421 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.12■■■■■ 4.33
BRF1-213ENST00000548421 MLECQ14165 292 aa42.11■■■■■ 4.33
BRF1-213ENST00000548421 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
BRF1-213ENST00000548421 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.04■■■■■ 4.32
BRF1-213ENST00000548421 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
BRF1-213ENST00000548421 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.98■■■■■ 4.31
BRF1-213ENST00000548421 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.97■■■■■ 4.31
BRF1-213ENST00000548421 NPATQ14207 1427 aa41.96■■■■■ 4.31
BRF1-213ENST00000548421 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.94■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.92■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 MROH2AA6NES4 1674 aa41.91■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.9■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 PLA2R1Q13018 1463 aa41.9■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 PTPRTO14522 1441 aa41.89■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
BRF1-213ENST00000548421 TRPM2O94759 1503 aa41.88■■■■■ 4.29
BRF1-213ENST00000548421 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
BRF1-213ENST00000548421 NEUROD1Q13562 356 aa41.83■■■■■ 4.29
BRF1-213ENST00000548421 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.82■■■■■ 4.29
BRF1-213ENST00000548421 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.81■■■■■ 4.28
BRF1-213ENST00000548421 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.81■■■■■ 4.28
BRF1-213ENST00000548421 MADDQ8WXG6 1647 aa41.79■■■■■ 4.28
BRF1-213ENST00000548421 ZMYM3Q14202 1370 aa41.78■■■■■ 4.28
BRF1-213ENST00000548421 NOS1P29475 1434 aa41.77■■■■■ 4.28
BRF1-213ENST00000548421 CLTCL1P53675 1640 aa41.74■■■■■ 4.27
BRF1-213ENST00000548421 ERVK-7P63135 1459 aa41.73■■■■■ 4.27
BRF1-213ENST00000548421 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
BRF1-213ENST00000548421 SYNMO15061 1565 aa41.71■■■■■ 4.27
BRF1-213ENST00000548421 C3P01024 1663 aa41.71■■■■■ 4.27
BRF1-213ENST00000548421 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.71■■■■■ 4.27
BRF1-213ENST00000548421 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.66■■■■■ 4.26
BRF1-213ENST00000548421 PIK3C2BO00750 1634 aa41.66■■■■■ 4.26
BRF1-213ENST00000548421 TONSLQ96HA7 1378 aa41.66■■■■■ 4.26
BRF1-213ENST00000548421 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.66■■■■■ 4.26
BRF1-213ENST00000548421 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
BRF1-213ENST00000548421 KIF1BO60333 1816 aa41.62■■■■■ 4.25
BRF1-213ENST00000548421 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
BRF1-213ENST00000548421 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.55■■■■■ 4.24
BRF1-213ENST00000548421 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.54■■■■■ 4.24
BRF1-213ENST00000548421 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
BRF1-213ENST00000548421 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.52■■■■■ 4.24
BRF1-213ENST00000548421 TNRQ92752 1358 aa41.49■■■■■ 4.23
BRF1-213ENST00000548421 ADGRB3O60242 1522 aa41.48■■■■■ 4.23
BRF1-213ENST00000548421 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.47■■■■■ 4.23
BRF1-213ENST00000548421 IDI1Q13907 227 aa41.46■■■■■ 4.23
BRF1-213ENST00000548421 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.41■■■■■ 4.22
BRF1-213ENST00000548421 PTPRMP28827 1452 aa41.41■■■■■ 4.22
BRF1-213ENST00000548421 RGL3Q3MIN7 710 aa41.4■■■■■ 4.22
BRF1-213ENST00000548421 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.39■■■■■ 4.22
BRF1-213ENST00000548421 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.37■■■■■ 4.21
BRF1-213ENST00000548421 NLRP1Q9C000 1473 aa41.37■■■■■ 4.21
BRF1-213ENST00000548421 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
BRF1-213ENST00000548421 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
BRF1-213ENST00000548421 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
BRF1-213ENST00000548421 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.32■■■■■ 4.21
BRF1-213ENST00000548421 IFT172Q9UG01 1749 aa41.32■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.3■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.27■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.27■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 PPLO60437 1756 aa41.27■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.26■■■■■ 4.2
BRF1-213ENST00000548421 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.25■■■■■ 4.19
BRF1-213ENST00000548421 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.22■■■■■ 4.19
BRF1-213ENST00000548421 STAC3Q96MF2 364 aa41.21■■■■■ 4.19
BRF1-213ENST00000548421 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.21■■■■■ 4.19
BRF1-213ENST00000548421 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.2■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms