RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 ERBINQ96RT1 1412 aa28.67■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 UNC13BO14795 1591 aa28.66■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 NEO1Q92859 1461 aa28.65■■■□□ 2.18
TSTA3-214ENST00000531473 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TSTA3-214ENST00000531473 KDM5CP41229 1560 aa28.63■■■□□ 2.17
TSTA3-214ENST00000531473 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.6■■■□□ 2.17
TSTA3-214ENST00000531473 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.59■■■□□ 2.17
TSTA3-214ENST00000531473 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
TSTA3-214ENST00000531473 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.59■■■□□ 2.17
TSTA3-214ENST00000531473 KIF3BO15066 747 aa28.58■■■□□ 2.17
TSTA3-214ENST00000531473 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.57■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 RICTORQ6R327 1708 aa28.56■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.55■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.55■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.55■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 ABCA6Q8N139 1617 aa28.53■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.53■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.52■■■□□ 2.16
TSTA3-214ENST00000531473 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
TSTA3-214ENST00000531473 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.5■■■□□ 2.15
TSTA3-214ENST00000531473 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.5■■■□□ 2.15
TSTA3-214ENST00000531473 A2MP01023 1474 aa28.49■■■□□ 2.15
TSTA3-214ENST00000531473 PLA2R1Q13018 1463 aa28.49■■■□□ 2.15
TSTA3-214ENST00000531473 DEPDC5O75140 1603 aa28.47■■■□□ 2.15
TSTA3-214ENST00000531473 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.47■■■□□ 2.15
TSTA3-214ENST00000531473 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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TSTA3-214ENST00000531473 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.43■■■□□ 2.14
TSTA3-214ENST00000531473 GGT6Q6P531 493 aa28.41■■■□□ 2.14
TSTA3-214ENST00000531473 BCL11AQ9H165 835 aa28.41■■■□□ 2.14
TSTA3-214ENST00000531473 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
TSTA3-214ENST00000531473 E9PCH4 1651 aa28.4■■■□□ 2.14
TSTA3-214ENST00000531473 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TSTA3-214ENST00000531473 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.38■■■□□ 2.13
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.34■■■□□ 2.13
TSTA3-214ENST00000531473 RGL3Q3MIN7 710 aa28.33■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 CEP152O94986 1710 aa28.32■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 KANK1Q14678 1352 aa28.32■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.31■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 ATP10AO60312 1499 aa28.31■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 TET3O43151 1660 aa28.3■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.3■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.27■■■□□ 2.12
TSTA3-214ENST00000531473 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.26■■■□□ 2.11
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TSTA3-214ENST00000531473 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
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TSTA3-214ENST00000531473 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.24■■■□□ 2.11
TSTA3-214ENST00000531473 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.23■■■□□ 2.11
TSTA3-214ENST00000531473 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.22■■■□□ 2.11
TSTA3-214ENST00000531473 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-214ENST00000531473 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.21■■■□□ 2.11
TSTA3-214ENST00000531473 PTPRTO14522 1441 aa28.2■■■□□ 2.1
TSTA3-214ENST00000531473 CLTCL1P53675 1640 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-214ENST00000531473 ABCC3O15438 1527 aa28.19■■■□□ 2.1
TSTA3-214ENST00000531473 TRPM2O94759 1503 aa28.19■■■□□ 2.1
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TSTA3-214ENST00000531473 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.16■■■□□ 2.1
TSTA3-214ENST00000531473 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
TSTA3-214ENST00000531473 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.13■■■□□ 2.09
TSTA3-214ENST00000531473 MLECQ14165 292 aa28.12■■■□□ 2.09
TSTA3-214ENST00000531473 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.1■■■□□ 2.09
TSTA3-214ENST00000531473 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.09■■■□□ 2.09
TSTA3-214ENST00000531473 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
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TSTA3-214ENST00000531473 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.05■■■□□ 2.08
TSTA3-214ENST00000531473 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TSTA3-214ENST00000531473 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.03■■■□□ 2.08
TSTA3-214ENST00000531473 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.01■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 REREQ9P2R6 1566 aa28■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 MROH2AA6NES4 1674 aa28■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.98■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 AGLP35573 1532 aa27.97■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.97■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 USP47Q96K76 1375 aa27.97■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 SYNMO15061 1565 aa27.97■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.96■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
TSTA3-214ENST00000531473 NOS1P29475 1434 aa27.95■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 KIF1BO60333 1816 aa27.94■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.92■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 FKBP8Q14318 412 aa27.91■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.9■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 ANP32CO43423 234 aa27.89■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 IDI1Q13907 227 aa27.89■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 MADDQ8WXG6 1647 aa27.89■■■□□ 2.06
TSTA3-214ENST00000531473 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.88■■■□□ 2.05
TSTA3-214ENST00000531473 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TSTA3-214ENST00000531473 ADGRB3O60242 1522 aa27.87■■■□□ 2.05
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