RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, human

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN3-208	ENST00000531226	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PACSIN3-208	ENST00000531226	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PACSIN3-208	ENST00000531226	PTPRK	Q15262	1439 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PACSIN3-208	ENST00000531226	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	CEP152	O94986	1710 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	ROCK1	Q13464	1354 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZMYM3	Q14202	1370 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PACSIN3-208	ENST00000531226	ABCC3	O15438	1527 aa		29	■■■□□ 2.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		29	■■■□□ 2.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ITGAE	P38570	1179 aa		29	■■■□□ 2.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	NPAT	Q14207	1427 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PACSIN3-208	ENST00000531226	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	PZP	P20742	1482 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	UNC13B	O14795	1591 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PACSIN3-208	ENST00000531226	KANK1	Q14678	1352 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PACSIN3-208	ENST00000531226	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21	2e-10	■□□□□ 10.5
PACSIN3-208	ENST00000531226	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	TET3	O43151	1660 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	NAIP	Q13075	1403 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	TNR	Q92752	1358 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	HSPA2	P54652	639 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PACSIN3-208	ENST00000531226	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PACSIN3-208	ENST00000531226	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PACSIN3-208	ENST00000531226		E9PCH4	1651 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PACSIN3-208	ENST00000531226	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PACSIN3-208	ENST00000531226	NUP155	O75694	1391 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PACSIN3-208	ENST00000531226	SYNM	O15061	1565 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PACSIN3-208	ENST00000531226	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PACSIN3-208	ENST00000531226	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PACSIN3-208	ENST00000531226	NOS1	P29475	1434 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PACSIN3-208	ENST00000531226	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PACSIN3-208	ENST00000531226	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PACSIN3-208	ENST00000531226	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PACSIN3-208	ENST00000531226	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.57	■■■□□ 2.16
PACSIN3-208	ENST00000531226	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PACSIN3-208	ENST00000531226	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	PTPRT	O14522	1441 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.45	■■■□□ 2.15
PACSIN3-208	ENST00000531226	PKD2	Q13563	968 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	IDI1	Q13907	227 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLIT1	O75093	1534 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
PACSIN3-208	ENST00000531226	TRPM2	O94759	1503 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	MED14	O60244	1454 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	KIF1B	O60333	1816 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PACSIN3-208	ENST00000531226	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PACSIN3-208	ENST00000531226	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PACSIN3-208	ENST00000531226	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PACSIN3-208	ENST00000531226	LTK	P29376	864 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	HRC	P23327	699 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PACSIN3-208	ENST00000531226	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.21	■■■□□ 2.11

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