RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, human

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSNARE1-208	ENST00000524325	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TSNARE1-208	ENST00000524325	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.63	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	AGL	P35573	1532 aa		33.63	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	FOXD1	Q16676	465 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	PZP	P20742	1482 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	UNC13B	O14795	1591 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TSNARE1-208	ENST00000524325	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	KANK1	Q14678	1352 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	PKD2	Q13563	968 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.96
TSNARE1-208	ENST00000524325	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TSNARE1-208	ENST00000524325	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TSNARE1-208	ENST00000524325	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
TSNARE1-208	ENST00000524325	ABCC3	O15438	1527 aa		33.45	■■■□□ 2.95
TSNARE1-208	ENST00000524325	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.45	■■■□□ 2.94
TSNARE1-208	ENST00000524325	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
TSNARE1-208	ENST00000524325	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.41	■■■□□ 2.94
TSNARE1-208	ENST00000524325	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.4	■■■□□ 2.94
TSNARE1-208	ENST00000524325	CEP152	O94986	1710 aa		33.39	■■■□□ 2.94
TSNARE1-208	ENST00000524325	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.35	■■■□□ 2.93
TSNARE1-208	ENST00000524325	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
TSNARE1-208	ENST00000524325	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
TSNARE1-208	ENST00000524325	NPAT	Q14207	1427 aa		33.33	■■■□□ 2.93
TSNARE1-208	ENST00000524325	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.32	■■■□□ 2.92
TSNARE1-208	ENST00000524325	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TSNARE1-208	ENST00000524325	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TSNARE1-208	ENST00000524325	TET3	O43151	1660 aa		33.3	■■■□□ 2.92
TSNARE1-208	ENST00000524325	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TSNARE1-208	ENST00000524325		E9PCH4	1651 aa		33.27	■■■□□ 2.92
TSNARE1-208	ENST00000524325	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.26	■■■□□ 2.92
TSNARE1-208	ENST00000524325	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.26	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.25	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.24	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.24	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.22	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.21	■■■□□ 2.91
TSNARE1-208	ENST00000524325	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
TSNARE1-208	ENST00000524325	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
TSNARE1-208	ENST00000524325	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
TSNARE1-208	ENST00000524325	PTPRT	O14522	1441 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TSNARE1-208	ENST00000524325	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TSNARE1-208	ENST00000524325	NOS1	P29475	1434 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TSNARE1-208	ENST00000524325	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TSNARE1-208	ENST00000524325	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TSNARE1-208	ENST00000524325	PTPRM	P28827	1452 aa		33.07	■■■□□ 2.89
TSNARE1-208	ENST00000524325	C3	P01024	1663 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	IDI1	Q13907	227 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	SYNM	O15061	1565 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	TRPM2	O94759	1503 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	TNR	Q92752	1358 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TSNARE1-208	ENST00000524325	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.01	■■■□□ 2.87
TSNARE1-208	ENST00000524325	CLTCL1	P53675	1640 aa		33	■■■□□ 2.87
TSNARE1-208	ENST00000524325	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TSNARE1-208	ENST00000524325	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TSNARE1-208	ENST00000524325	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.9	■■■□□ 2.86
TSNARE1-208	ENST00000524325	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.88	■■■□□ 2.85
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
TSNARE1-208	ENST00000524325	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TSNARE1-208	ENST00000524325	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.87	■■■□□ 2.85
TSNARE1-208	ENST00000524325	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.84	■■■□□ 2.85
TSNARE1-208	ENST00000524325	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
TSNARE1-208	ENST00000524325	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.81	■■■□□ 2.84
TSNARE1-208	ENST00000524325	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
TSNARE1-208	ENST00000524325	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.79	■■■□□ 2.84
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.77	■■■□□ 2.84
TSNARE1-208	ENST00000524325	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.76	■■■□□ 2.84
TSNARE1-208	ENST00000524325	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.75	■■■□□ 2.83
TSNARE1-208	ENST00000524325	KIF1B	O60333	1816 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TSNARE1-208	ENST00000524325	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TSNARE1-208	ENST00000524325	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	HSPA2	P54652	639 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TSNARE1-208	ENST00000524325	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.64	■■■□□ 2.82

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