RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 ROCK1Q13464 1354 aa27.4■■□□□ 1.98
RASGEF1B-205ENST00000507538 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.4■■□□□ 1.98
RASGEF1B-205ENST00000507538 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.35■■□□□ 1.97
RASGEF1B-205ENST00000507538 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.34■■□□□ 1.97
RASGEF1B-205ENST00000507538 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.32■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.31■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.3■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZMYM3Q14202 1370 aa27.3■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.29■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 MROH2AA6NES4 1674 aa27.29■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
RASGEF1B-205ENST00000507538 C3P01024 1663 aa27.26■■□□□ 1.95
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCC3O15438 1527 aa27.26■■□□□ 1.95
RASGEF1B-205ENST00000507538 DEPDC5O75140 1603 aa27.24■■□□□ 1.95
RASGEF1B-205ENST00000507538 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RASGEF1B-205ENST00000507538 NPATQ14207 1427 aa27.2■■□□□ 1.94
RASGEF1B-205ENST00000507538 KANK1Q14678 1352 aa27.2■■□□□ 1.94
RASGEF1B-205ENST00000507538 PZPP20742 1482 aa27.18■■□□□ 1.94
RASGEF1B-205ENST00000507538 NAIPQ13075 1403 aa27.17■■□□□ 1.94
RASGEF1B-205ENST00000507538 HFM1A2PYH4 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
RASGEF1B-205ENST00000507538 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.16■■□□□ 1.94
RASGEF1B-205ENST00000507538 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.15■■□□□ 1.94
RASGEF1B-205ENST00000507538 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.13■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 UNC13BO14795 1591 aa27.13■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 CEP152O94986 1710 aa27.12■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.11■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.11■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.11■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.09■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.09■■□□□ 1.93
RASGEF1B-205ENST00000507538 TNRQ92752 1358 aa27.07■■□□□ 1.92
RASGEF1B-205ENST00000507538 ERVK-7P63135 1459 aa27.05■■□□□ 1.92
RASGEF1B-205ENST00000507538 NUP155O75694 1391 aa27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1B-205ENST00000507538 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.04■■□□□ 1.92
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.02■■□□□ 1.92
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.01■■□□□ 1.92
RASGEF1B-205ENST00000507538 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 HSPA2P54652 639 aa27.01■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.01■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 TET3O43151 1660 aa26.98■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.95■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 NLRP1Q9C000 1473 aa26.95■■□□□ 1.91
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
RASGEF1B-205ENST00000507538 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.93■■□□□ 1.9
RASGEF1B-205ENST00000507538 NOS1P29475 1434 aa26.91■■□□□ 1.9
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRIM52Q96A61 297 aa26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1B-205ENST00000507538 E9PCH4 1651 aa26.86■■□□□ 1.89
RASGEF1B-205ENST00000507538 SYNMO15061 1565 aa26.86■■□□□ 1.89
RASGEF1B-205ENST00000507538 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1B-205ENST00000507538 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1B-205ENST00000507538 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLA2R1Q13018 1463 aa26.81■■□□□ 1.88
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RASGEF1B-205ENST00000507538 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
RASGEF1B-205ENST00000507538 IDI1Q13907 227 aa26.79■■□□□ 1.88
RASGEF1B-205ENST00000507538 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.79■■□□□ 1.88
RASGEF1B-205ENST00000507538 PKD2Q13563 968 aa26.77■■□□□ 1.88
RASGEF1B-205ENST00000507538 PTPRTO14522 1441 aa26.76■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 PIK3C2BO00750 1634 aa26.76■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 STRCQ7RTU9 1775 aa26.74■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.73■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.72■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADGRB3O60242 1522 aa26.72■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.72■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.72■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 HRCP23327 699 aa26.71■■□□□ 1.87
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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RASGEF1B-205ENST00000507538 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.69■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRPM2O94759 1503 aa26.69■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.67■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.67■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLIT1O75093 1534 aa26.66■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 FOXD1Q16676 465 aa26.66■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.66■■□□□ 1.86
RASGEF1B-205ENST00000507538 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.63■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.61■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 CLTCL1P53675 1640 aa26.61■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 LTKP29376 864 aa26.59■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.59■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 EID1Q9Y6B2 187 aa26.59■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 MED14O60244 1454 aa26.59■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZFYVE9O95405 1425 aa26.56■■□□□ 1.84
RASGEF1B-205ENST00000507538 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.55■■□□□ 1.84
RASGEF1B-205ENST00000507538 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.53■■□□□ 1.84
RASGEF1B-205ENST00000507538 IQGAP1P46940 1657 aa26.5■■□□□ 1.83
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.49■■□□□ 1.83
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