RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498834.5

VSTM2A-208, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2

Gene VSTM2A, Length 803 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-208ENST00000498834 SNPHO15079 494 aa11.16□□□□□ -0.62
VSTM2A-208ENST00000498834 KIAA0556O60303 1618 aa11.15□□□□□ -0.62
VSTM2A-208ENST00000498834 FMN1Q68DA7 1419 aa11.15□□□□□ -0.62
VSTM2A-208ENST00000498834 NLRP6P59044 892 aa11.14□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 SAMD9Q5K651 1589 aa11.12□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 ARID3CA6NKF2 412 aa11.12□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.12□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.12□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.12□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.1□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 POTEMA6NI47 508 aa11.09□□□□□ -0.63
VSTM2A-208ENST00000498834 POTEGQ6S5H5 508 aa11.08□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 ABCC2Q92887 1545 aa11.08□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 KCNH8Q96L42 1107 aa11.07□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.06□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 ATP10BO94823 1461 aa11.06□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 ABCA8O94911 1581 aa11.05□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.04□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.04□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.03□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 MICALL2Q8IY33 904 aa11.03□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
VSTM2A-208ENST00000498834 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.02□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.02□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 ASXL2Q76L83 1435 aa11.01□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 ST18O60284 1047 aa11.01□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 MFRPQ9BY79 579 aa11.01□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.99□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.99□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.99□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.98□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.97□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 MAPKBP1O60336 1514 aa10.96□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.96□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.96□□□□□ -0.65
VSTM2A-208ENST00000498834 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.95□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.95□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 HECW1Q76N89 1606 aa10.95□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 DOK7Q18PE1 504 aa10.94□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 RIMBP2O15034 1052 aa10.93□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 CD109Q6YHK3 1445 aa10.91□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.9□□□□□ -0.66
VSTM2A-208ENST00000498834 MAP3K1Q13233 1512 aa10.89□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 EMP3P54852 163 aa10.87□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 MARVELD3Q96A59 401 aa10.87□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.87□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.87□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.86□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 TMC2Q8TDI7 906 aa10.86□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.86□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 GLI2P10070 1586 aa10.86□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.85□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 PLCH2O75038 1416 aa10.84□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.84□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 TIAM1Q13009 1591 aa10.84□□□□□ -0.67
VSTM2A-208ENST00000498834 DIP2BQ9P265 1576 aa10.83□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 PPP1R37O75864 691 aa10.82□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.82□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.81□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.81□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.8□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.8□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 NCOA2Q15596 1464 aa10.8□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 C2orf72A6NCS6 295 aa10.79□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 FAM205CA6NFA0 338 aa10.79□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 RSPH4AQ5TD94 716 aa10.79□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 KIF14Q15058 1648 aa10.79□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 AKNAQ7Z591 1439 aa10.78□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 ABCA9Q8IUA7 1624 aa10.78□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
VSTM2A-208ENST00000498834 FANCAO15360 1455 aa10.77□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 NEO1Q92859 1461 aa10.77□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 RAPGEF3O95398 923 aa10.77□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.77□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 ERBB3P21860 1342 aa10.76□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.75□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.75□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 TSPY4P0CV99 314 aa10.75□□□□□ -0.69
VSTM2A-208ENST00000498834 TSPY10P0CW01 314 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms