RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491053.5

USP20-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 590 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-206ENST00000491053 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP20-206ENST00000491053 GGT6Q6P531 493 aa25.15■■□□□ 1.62
USP20-206ENST00000491053 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.15■■□□□ 1.62
USP20-206ENST00000491053 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.14■■□□□ 1.62
USP20-206ENST00000491053 PTPRKQ15262 1439 aa25.13■■□□□ 1.61
USP20-206ENST00000491053 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
USP20-206ENST00000491053 ROCK1Q13464 1354 aa25.13■■□□□ 1.61
USP20-206ENST00000491053 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USP20-206ENST00000491053 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.11■■□□□ 1.61
USP20-206ENST00000491053 DEPDC5O75140 1603 aa25.1■■□□□ 1.61
USP20-206ENST00000491053 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.09■■□□□ 1.61
USP20-206ENST00000491053 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 ZMYM3Q14202 1370 aa25.05■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.04■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.04■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 ITGAEP38570 1179 aa25.02■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.02■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 NPATQ14207 1427 aa25.02■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 ABCC3O15438 1527 aa25.02■■□□□ 1.6
USP20-206ENST00000491053 CEP152O94986 1710 aa25.01■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.01■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.97■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.97■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 PZPP20742 1482 aa24.96■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.96■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 KANK1Q14678 1352 aa24.96■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.96■■□□□ 1.59
USP20-206ENST00000491053 UNC13BO14795 1591 aa24.95■■□□□ 1.58
USP20-206ENST00000491053 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.93■■□□□ 1.58
USP20-206ENST00000491053 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.93■■□□□ 1.58
USP20-206ENST00000491053 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.89■■□□□ 1.58
USP20-206ENST00000491053 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
USP20-206ENST00000491053 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.89■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 HFM1A2PYH4 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 NAIPQ13075 1403 aa24.87■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.86■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 TET3O43151 1660 aa24.85■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.85■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.84■■□□□ 1.57
USP20-206ENST00000491053 ERVK-7P63135 1459 aa24.83■■□□□ 1.56
USP20-206ENST00000491053 TNRQ92752 1358 aa24.82■■□□□ 1.56
USP20-206ENST00000491053 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
USP20-206ENST00000491053 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
USP20-206ENST00000491053 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
USP20-206ENST00000491053 NLRP1Q9C000 1473 aa24.79■■□□□ 1.56
USP20-206ENST00000491053 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.77■■□□□ 1.56
USP20-206ENST00000491053 NUP155O75694 1391 aa24.76■■□□□ 1.55
USP20-206ENST00000491053 HSPA2P54652 639 aa24.74■■□□□ 1.55
USP20-206ENST00000491053 E9PCH4 1651 aa24.73■■□□□ 1.55
USP20-206ENST00000491053 NOS1P29475 1434 aa24.7■■□□□ 1.55
USP20-206ENST00000491053 STRCQ7RTU9 1775 aa24.7■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 PLA2R1Q13018 1463 aa24.69■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.68■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 SYNMO15061 1565 aa24.67■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.65■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.65■■□□□ 1.54
USP20-206ENST00000491053 PIK3C2BO00750 1634 aa24.62■■□□□ 1.53
USP20-206ENST00000491053 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
USP20-206ENST00000491053 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.61■■□□□ 1.53
USP20-206ENST00000491053 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
USP20-206ENST00000491053 TRIM52Q96A61 297 aa24.6■■□□□ 1.53
USP20-206ENST00000491053 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.6■■□□□ 1.53
USP20-206ENST00000491053 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.59■■□□□ 1.53
USP20-206ENST00000491053 PKD2Q13563 968 aa24.57■■□□□ 1.52
USP20-206ENST00000491053 ADGRB3O60242 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
USP20-206ENST00000491053 PTPRTO14522 1441 aa24.55■■□□□ 1.52
USP20-206ENST00000491053 IDI1Q13907 227 aa24.55■■□□□ 1.52
USP20-206ENST00000491053 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.54■■□□□ 1.52
USP20-206ENST00000491053 SLIT1O75093 1534 aa24.53■■□□□ 1.52
USP20-206ENST00000491053 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
USP20-206ENST00000491053 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.51■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 TRPM2O94759 1503 aa24.51■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.51■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 HRCP23327 699 aa24.5■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.5■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.5■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.5■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.49■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.48■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 MED14O60244 1454 aa24.47■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.46■■□□□ 1.51
USP20-206ENST00000491053 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.45■■□□□ 1.5
USP20-206ENST00000491053 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
USP20-206ENST00000491053 KIF1BO60333 1816 aa24.45■■□□□ 1.5
USP20-206ENST00000491053 IQGAP1P46940 1657 aa24.44■■□□□ 1.5
USP20-206ENST00000491053 CLTCL1P53675 1640 aa24.44■■□□□ 1.5
USP20-206ENST00000491053 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP20-206ENST00000491053 EID1Q9Y6B2 187 aa24.4■■□□□ 1.5
USP20-206ENST00000491053 ZFYVE9O95405 1425 aa24.37■■□□□ 1.49
USP20-206ENST00000491053 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
USP20-206ENST00000491053 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.37■■□□□ 1.49
USP20-206ENST00000491053 LTKP29376 864 aa24.36■■□□□ 1.49
USP20-206ENST00000491053 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
USP20-206ENST00000491053 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
USP20-206ENST00000491053 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.7 ms