RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SOGA3-206ENST00000474293 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SOGA3-206ENST00000474293 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SOGA3-206ENST00000474293 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.97■■□□□ 1.43
SOGA3-206ENST00000474293 POTEAQ6S8J7 498 aa23.97■■□□□ 1.43
SOGA3-206ENST00000474293 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SOGA3-206ENST00000474293 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SOGA3-206ENST00000474293 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.94■■□□□ 1.42
SOGA3-206ENST00000474293 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.94■■□□□ 1.42
SOGA3-206ENST00000474293 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.93■■□□□ 1.42
SOGA3-206ENST00000474293 MED14O60244 1454 aa23.9■■□□□ 1.42
SOGA3-206ENST00000474293 KIF3BO15066 747 aa23.9■■□□□ 1.42
SOGA3-206ENST00000474293 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.89■■□□□ 1.42
SOGA3-206ENST00000474293 PZPP20742 1482 aa23.87■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.87■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.87■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.87■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.86■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.86■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 MIA2Q96PC5 1412 aa23.86■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.85■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 DEPDC5O75140 1603 aa23.84■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 IQGAP1P46940 1657 aa23.83■■□□□ 1.41
SOGA3-206ENST00000474293 NLRP1Q9C000 1473 aa23.82■■□□□ 1.4
SOGA3-206ENST00000474293 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.81■■□□□ 1.4
SOGA3-206ENST00000474293 SYNMO15061 1565 aa23.78■■□□□ 1.4
SOGA3-206ENST00000474293 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.75■■□□□ 1.39
SOGA3-206ENST00000474293 MBD5Q9P267 1494 aa23.75■■□□□ 1.39
SOGA3-206ENST00000474293 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.75■■□□□ 1.39
SOGA3-206ENST00000474293 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SOGA3-206ENST00000474293 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.7■■□□□ 1.38
SOGA3-206ENST00000474293 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.68■■□□□ 1.38
SOGA3-206ENST00000474293 LTKP29376 864 aa23.67■■□□□ 1.38
SOGA3-206ENST00000474293 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.66■■□□□ 1.38
SOGA3-206ENST00000474293 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SOGA3-206ENST00000474293 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SOGA3-206ENST00000474293 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 TIAM1Q13009 1591 aa23.62■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 TMEM94Q12767 1356 aa23.6■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 TRIM52Q96A61 297 aa23.59■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 ERVK-7P63135 1459 aa23.59■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.59■■□□□ 1.37
SOGA3-206ENST00000474293 NCOA2Q15596 1464 aa23.57■■□□□ 1.36
SOGA3-206ENST00000474293 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.57■■□□□ 1.36
SOGA3-206ENST00000474293 ABCC3O15438 1527 aa23.56■■□□□ 1.36
SOGA3-206ENST00000474293 EID1Q9Y6B2 187 aa23.55■■□□□ 1.36
SOGA3-206ENST00000474293 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SOGA3-206ENST00000474293 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.53■■□□□ 1.36
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.52■■□□□ 1.36
SOGA3-206ENST00000474293 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.51■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 JCADQ9P266 1359 aa23.51■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.5■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 TSPY4P0CV99 314 aa23.5■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 TSPY10P0CW01 314 aa23.5■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 SLIT1O75093 1534 aa23.49■■□□□ 1.35
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SOGA3-206ENST00000474293 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.48■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 MAP3K1Q13233 1512 aa23.47■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 CEP162Q5TB80 1403 aa23.46■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.46■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 SLAIN2Q9P270 581 aa23.46■■□□□ 1.35
SOGA3-206ENST00000474293 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.44■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.43■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 PHLPP1O60346 1717 aa23.43■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 LRP6O75581 1613 aa23.43■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.42■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 MSH6P52701 1360 aa23.41■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 RXRBP28702 533 aa23.4■■□□□ 1.34
SOGA3-206ENST00000474293 CEP152O94986 1710 aa23.39■■□□□ 1.33
SOGA3-206ENST00000474293 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.38■■□□□ 1.33
SOGA3-206ENST00000474293 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SOGA3-206ENST00000474293 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.36■■□□□ 1.33
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.36■■□□□ 1.33
SOGA3-206ENST00000474293 BCANQ96GW7 911 aa23.36■■□□□ 1.33
SOGA3-206ENST00000474293 PIK3C2BO00750 1634 aa23.34■■□□□ 1.33
SOGA3-206ENST00000474293 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 IDI1Q13907 227 aa23.31■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 TET3O43151 1660 aa23.31■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.29■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.28■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.28■■□□□ 1.32
SOGA3-206ENST00000474293 NWD1Q149M9 1564 aa23.26■■□□□ 1.31
SOGA3-206ENST00000474293 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.26■■□□□ 1.31
SOGA3-206ENST00000474293 C14orf37Q86TY3 774 aa23.25■■□□□ 1.31
SOGA3-206ENST00000474293 AFF2P51816 1311 aa23.24■■□□□ 1.31
SOGA3-206ENST00000474293 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
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