RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417145.2

GGTLC2-201, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

TSL 2

Gene GGTLC2, Length 952 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-201ENST00000417145 ITGAEP38570 1179 aa30.58■■■□□ 2.49
GGTLC2-201ENST00000417145 PTPRKQ15262 1439 aa30.56■■■□□ 2.48
GGTLC2-201ENST00000417145 ROCK1Q13464 1354 aa30.54■■■□□ 2.48
GGTLC2-201ENST00000417145 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
GGTLC2-201ENST00000417145 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.51■■■□□ 2.47
GGTLC2-201ENST00000417145 MROH2AA6NES4 1674 aa30.49■■■□□ 2.47
GGTLC2-201ENST00000417145 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
GGTLC2-201ENST00000417145 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTLC2-201ENST00000417145 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTLC2-201ENST00000417145 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTLC2-201ENST00000417145 ZMYM3Q14202 1370 aa30.44■■■□□ 2.46
GGTLC2-201ENST00000417145 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
GGTLC2-201ENST00000417145 C3P01024 1663 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTLC2-201ENST00000417145 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTLC2-201ENST00000417145 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.4■■■□□ 2.46
GGTLC2-201ENST00000417145 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
GGTLC2-201ENST00000417145 DEPDC5O75140 1603 aa30.39■■■□□ 2.46
GGTLC2-201ENST00000417145 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
GGTLC2-201ENST00000417145 KANK1Q14678 1352 aa30.38■■■□□ 2.45
GGTLC2-201ENST00000417145 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.36■■■□□ 2.45
GGTLC2-201ENST00000417145 ABCC3O15438 1527 aa30.36■■■□□ 2.45
GGTLC2-201ENST00000417145 NPATQ14207 1427 aa30.33■■■□□ 2.45
GGTLC2-201ENST00000417145 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.3■■■□□ 2.44
GGTLC2-201ENST00000417145 HSPA2P54652 639 aa30.29■■■□□ 2.44
GGTLC2-201ENST00000417145 PZPP20742 1482 aa30.29■■■□□ 2.44
GGTLC2-201ENST00000417145 CEP152O94986 1710 aa30.28■■■□□ 2.44
GGTLC2-201ENST00000417145 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
GGTLC2-201ENST00000417145 HFM1A2PYH4 1435 aa30.26■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 NAIPQ13075 1403 aa30.26■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.25■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.25■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.25■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.25■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 UNC13BO14795 1591 aa30.24■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.23■■■□□ 2.43
GGTLC2-201ENST00000417145 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.2■■■□□ 2.42
GGTLC2-201ENST00000417145 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
GGTLC2-201ENST00000417145 TNRQ92752 1358 aa30.16■■■□□ 2.42
GGTLC2-201ENST00000417145 NUP155O75694 1391 aa30.15■■■□□ 2.42
GGTLC2-201ENST00000417145 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.14■■■□□ 2.42
GGTLC2-201ENST00000417145 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.14■■■□□ 2.41
GGTLC2-201ENST00000417145 ERVK-7P63135 1459 aa30.13■■■□□ 2.41
GGTLC2-201ENST00000417145 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.13■■■□□ 2.41
GGTLC2-201ENST00000417145 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.12■■■□□ 2.41
GGTLC2-201ENST00000417145 TET3O43151 1660 aa30.11■■■□□ 2.41
GGTLC2-201ENST00000417145 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
GGTLC2-201ENST00000417145 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.41
GGTLC2-201ENST00000417145 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
GGTLC2-201ENST00000417145 NLRP1Q9C000 1473 aa30.07■■■□□ 2.4
GGTLC2-201ENST00000417145 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.06■■■□□ 2.4
GGTLC2-201ENST00000417145 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
GGTLC2-201ENST00000417145 TRIM52Q96A61 297 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTLC2-201ENST00000417145 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.02■■■□□ 2.4
GGTLC2-201ENST00000417145 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
GGTLC2-201ENST00000417145 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
GGTLC2-201ENST00000417145 STRCQ7RTU9 1775 aa29.99■■■□□ 2.39
GGTLC2-201ENST00000417145 NOS1P29475 1434 aa29.97■■■□□ 2.39
GGTLC2-201ENST00000417145 E9PCH4 1651 aa29.97■■■□□ 2.39
GGTLC2-201ENST00000417145 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.94■■■□□ 2.38
GGTLC2-201ENST00000417145 SYNMO15061 1565 aa29.93■■■□□ 2.38
GGTLC2-201ENST00000417145 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTLC2-201ENST00000417145 PLA2R1Q13018 1463 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTLC2-201ENST00000417145 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.9■■■□□ 2.38
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
GGTLC2-201ENST00000417145 IDI1Q13907 227 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTLC2-201ENST00000417145 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTLC2-201ENST00000417145 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTLC2-201ENST00000417145 PKD2Q13563 968 aa29.85■■■□□ 2.37
GGTLC2-201ENST00000417145 PIK3C2BO00750 1634 aa29.85■■■□□ 2.37
GGTLC2-201ENST00000417145 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.84■■■□□ 2.37
GGTLC2-201ENST00000417145 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 HRCP23327 699 aa29.81■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.81■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 PTPRTO14522 1441 aa29.8■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.79■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 ADGRB3O60242 1522 aa29.79■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.78■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.78■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GGTLC2-201ENST00000417145 TRPM2O94759 1503 aa29.75■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 FBXO41Q8TF61 875 aa29.74■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 SLIT1O75093 1534 aa29.73■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 EID1Q9Y6B2 187 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.71■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 CERKQ8TCT0 537 aa29.7■■■□□ 2.35
GGTLC2-201ENST00000417145 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.69■■■□□ 2.34
GGTLC2-201ENST00000417145 FOXD1Q16676 465 aa29.68■■■□□ 2.34
GGTLC2-201ENST00000417145 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
GGTLC2-201ENST00000417145 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.67■■■□□ 2.34
GGTLC2-201ENST00000417145 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.66■■■□□ 2.34
GGTLC2-201ENST00000417145 CLTCL1P53675 1640 aa29.65■■■□□ 2.34
GGTLC2-201ENST00000417145 MED14O60244 1454 aa29.65■■■□□ 2.34
GGTLC2-201ENST00000417145 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
GGTLC2-201ENST00000417145 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
GGTLC2-201ENST00000417145 LTKP29376 864 aa29.62■■■□□ 2.33
GGTLC2-201ENST00000417145 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms