RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 MROH2AA6NES4 1674 aa31.18■■■□□ 2.58
CLDN3-201ENST00000395145 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CLDN3-201ENST00000395145 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.17■■■□□ 2.58
CLDN3-201ENST00000395145 ROCK1Q13464 1354 aa31.15■■■□□ 2.58
CLDN3-201ENST00000395145 C3P01024 1663 aa31.13■■■□□ 2.57
CLDN3-201ENST00000395145 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
CLDN3-201ENST00000395145 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.1■■■□□ 2.57
CLDN3-201ENST00000395145 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.09■■■□□ 2.57
CLDN3-201ENST00000395145 DEPDC5O75140 1603 aa31.07■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 ZMYM3Q14202 1370 aa31.06■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 ITGAEP38570 1179 aa31.06■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.05■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.02■■■□□ 2.56
CLDN3-201ENST00000395145 ABCC3O15438 1527 aa31.01■■■□□ 2.55
CLDN3-201ENST00000395145 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CLDN3-201ENST00000395145 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31■■■□□ 2.55
CLDN3-201ENST00000395145 NPATQ14207 1427 aa30.98■■■□□ 2.55
CLDN3-201ENST00000395145 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.96■■■□□ 2.55
CLDN3-201ENST00000395145 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.95■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 CEP152O94986 1710 aa30.95■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.95■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 PZPP20742 1482 aa30.94■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 KANK1Q14678 1352 aa30.91■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.91■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 UNC13BO14795 1591 aa30.9■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.89■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.89■■■□□ 2.54
CLDN3-201ENST00000395145 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
CLDN3-201ENST00000395145 NAIPQ13075 1403 aa30.87■■■□□ 2.53
CLDN3-201ENST00000395145 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.86■■■□□ 2.53
CLDN3-201ENST00000395145 HFM1A2PYH4 1435 aa30.85■■■□□ 2.53
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.85■■■□□ 2.53
CLDN3-201ENST00000395145 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.8■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.79■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.78■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 ERVK-7P63135 1459 aa30.77■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.77■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 TNRQ92752 1358 aa30.77■■■□□ 2.52
CLDN3-201ENST00000395145 TET3O43151 1660 aa30.75■■■□□ 2.51
CLDN3-201ENST00000395145 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CLDN3-201ENST00000395145 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
CLDN3-201ENST00000395145 NUP155O75694 1391 aa30.7■■■□□ 2.51
CLDN3-201ENST00000395145 HSPA2P54652 639 aa30.7■■■□□ 2.51
CLDN3-201ENST00000395145 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
CLDN3-201ENST00000395145 NLRP1Q9C000 1473 aa30.7■■■□□ 2.5
CLDN3-201ENST00000395145 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.69■■■□□ 2.5
CLDN3-201ENST00000395145 NOS1P29475 1434 aa30.64■■■□□ 2.49
CLDN3-201ENST00000395145 E9PCH4 1651 aa30.62■■■□□ 2.49
CLDN3-201ENST00000395145 SYNMO15061 1565 aa30.59■■■□□ 2.49
CLDN3-201ENST00000395145 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.57■■■□□ 2.48
CLDN3-201ENST00000395145 STRCQ7RTU9 1775 aa30.57■■■□□ 2.48
CLDN3-201ENST00000395145 PLA2R1Q13018 1463 aa30.57■■■□□ 2.48
CLDN3-201ENST00000395145 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.56■■■□□ 2.48
CLDN3-201ENST00000395145 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
CLDN3-201ENST00000395145 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.51■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 TRIM52Q96A61 297 aa30.51■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 PIK3C2BO00750 1634 aa30.5■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.47■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.46■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 IDI1Q13907 227 aa30.46■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.45■■■□□ 2.47
CLDN3-201ENST00000395145 PTPRTO14522 1441 aa30.44■■■□□ 2.46
CLDN3-201ENST00000395145 PKD2Q13563 968 aa30.43■■■□□ 2.46
CLDN3-201ENST00000395145 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CLDN3-201ENST00000395145 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.42■■■□□ 2.46
CLDN3-201ENST00000395145 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
CLDN3-201ENST00000395145 ADGRB3O60242 1522 aa30.41■■■□□ 2.46
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.38■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 SLIT1O75093 1534 aa30.38■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 HRCP23327 699 aa30.38■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.38■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 TRPM2O94759 1503 aa30.37■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.36■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.35■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.34■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.34■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.34■■■□□ 2.45
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.32■■■□□ 2.44
CLDN3-201ENST00000395145 MED14O60244 1454 aa30.31■■■□□ 2.44
CLDN3-201ENST00000395145 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.31■■■□□ 2.44
CLDN3-201ENST00000395145 CLTCL1P53675 1640 aa30.29■■■□□ 2.44
CLDN3-201ENST00000395145 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CLDN3-201ENST00000395145 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 LTKP29376 864 aa30.24■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 IQGAP1P46940 1657 aa30.23■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 ZFYVE9O95405 1425 aa30.22■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 FOXD1Q16676 465 aa30.22■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.22■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 EID1Q9Y6B2 187 aa30.22■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 KIF1BO60333 1816 aa30.2■■■□□ 2.43
CLDN3-201ENST00000395145 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
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