RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 DEPDC5O75140 1603 aa37.09■■■■□ 3.53
NTN3-201ENST00000293973 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.06■■■■□ 3.52
NTN3-201ENST00000293973 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
NTN3-201ENST00000293973 NUP155O75694 1391 aa37.06■■■■□ 3.52
NTN3-201ENST00000293973 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
NTN3-201ENST00000293973 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
NTN3-201ENST00000293973 PZPP20742 1482 aa37.01■■■■□ 3.52
NTN3-201ENST00000293973 AGLP35573 1532 aa37.01■■■■□ 3.52
NTN3-201ENST00000293973 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.01■■■■□ 3.51
NTN3-201ENST00000293973 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.01■■■■□ 3.51
NTN3-201ENST00000293973 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
NTN3-201ENST00000293973 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.99■■■■□ 3.51
NTN3-201ENST00000293973 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.98■■■■□ 3.51
NTN3-201ENST00000293973 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.97■■■■□ 3.51
NTN3-201ENST00000293973 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
NTN3-201ENST00000293973 GGT6Q6P531 493 aa36.93■■■■□ 3.5
NTN3-201ENST00000293973 KANK1Q14678 1352 aa36.92■■■■□ 3.5
NTN3-201ENST00000293973 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.92■■■■□ 3.5
NTN3-201ENST00000293973 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.83■■■■□ 3.49
NTN3-201ENST00000293973 CEP152O94986 1710 aa36.82■■■■□ 3.49
NTN3-201ENST00000293973 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 PKD2Q13563 968 aa36.82■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 TET3O43151 1660 aa36.81■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.79■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 FOXD1Q16676 465 aa36.78■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 ABCC3O15438 1527 aa36.78■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.77■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 MLECQ14165 292 aa36.76■■■■□ 3.48
NTN3-201ENST00000293973 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.73■■■■□ 3.47
NTN3-201ENST00000293973 E9PCH4 1651 aa36.73■■■■□ 3.47
NTN3-201ENST00000293973 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.72■■■■□ 3.47
NTN3-201ENST00000293973 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.69■■■■□ 3.46
NTN3-201ENST00000293973 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.67■■■■□ 3.46
NTN3-201ENST00000293973 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
NTN3-201ENST00000293973 NPATQ14207 1427 aa36.6■■■■□ 3.45
NTN3-201ENST00000293973 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
NTN3-201ENST00000293973 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.59■■■■□ 3.45
NTN3-201ENST00000293973 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
NTN3-201ENST00000293973 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.57■■■■□ 3.45
NTN3-201ENST00000293973 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.57■■■■□ 3.44
NTN3-201ENST00000293973 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
NTN3-201ENST00000293973 PLA2R1Q13018 1463 aa36.55■■■■□ 3.44
NTN3-201ENST00000293973 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.54■■■■□ 3.44
NTN3-201ENST00000293973 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.53■■■■□ 3.44
NTN3-201ENST00000293973 PTPRTO14522 1441 aa36.52■■■■□ 3.44
NTN3-201ENST00000293973 NEUROD1Q13562 356 aa36.52■■■■□ 3.44
NTN3-201ENST00000293973 TRPM2O94759 1503 aa36.5■■■■□ 3.43
NTN3-201ENST00000293973 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
NTN3-201ENST00000293973 MROH2AA6NES4 1674 aa36.49■■■■□ 3.43
NTN3-201ENST00000293973 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.46■■■■□ 3.43
NTN3-201ENST00000293973 ZMYM3Q14202 1370 aa36.46■■■■□ 3.43
NTN3-201ENST00000293973 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.44■■■■□ 3.42
NTN3-201ENST00000293973 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.44■■■■□ 3.42
NTN3-201ENST00000293973 NOS1P29475 1434 aa36.42■■■■□ 3.42
NTN3-201ENST00000293973 MADDQ8WXG6 1647 aa36.42■■■■□ 3.42
NTN3-201ENST00000293973 CLTCL1P53675 1640 aa36.38■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 ERVK-7P63135 1459 aa36.38■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 SYNMO15061 1565 aa36.36■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.35■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 C3P01024 1663 aa36.34■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.34■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 TONSLQ96HA7 1378 aa36.34■■■■□ 3.41
NTN3-201ENST00000293973 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.31■■■■□ 3.4
NTN3-201ENST00000293973 PIK3C2BO00750 1634 aa36.29■■■■□ 3.4
NTN3-201ENST00000293973 KIF1BO60333 1816 aa36.25■■■■□ 3.39
NTN3-201ENST00000293973 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
NTN3-201ENST00000293973 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.23■■■■□ 3.39
NTN3-201ENST00000293973 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.21■■■■□ 3.39
NTN3-201ENST00000293973 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.2■■■■□ 3.39
NTN3-201ENST00000293973 TNRQ92752 1358 aa36.19■■■■□ 3.38
NTN3-201ENST00000293973 IDI1Q13907 227 aa36.18■■■■□ 3.38
NTN3-201ENST00000293973 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.17■■■■□ 3.38
NTN3-201ENST00000293973 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.17■■■■□ 3.38
NTN3-201ENST00000293973 RGL3Q3MIN7 710 aa36.15■■■■□ 3.38
NTN3-201ENST00000293973 ADGRB3O60242 1522 aa36.15■■■■□ 3.38
NTN3-201ENST00000293973 PTPRMP28827 1452 aa36.11■■■■□ 3.37
NTN3-201ENST00000293973 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
NTN3-201ENST00000293973 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
NTN3-201ENST00000293973 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.08■■■■□ 3.37
NTN3-201ENST00000293973 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.06■■■■□ 3.36
NTN3-201ENST00000293973 NLRP1Q9C000 1473 aa36.05■■■■□ 3.36
NTN3-201ENST00000293973 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.04■■■■□ 3.36
NTN3-201ENST00000293973 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.04■■■■□ 3.36
NTN3-201ENST00000293973 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
NTN3-201ENST00000293973 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.01■■■■□ 3.36
NTN3-201ENST00000293973 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 IFT172Q9UG01 1749 aa35.99■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.98■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.97■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.96■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 PPLO60437 1756 aa35.95■■■■□ 3.35
NTN3-201ENST00000293973 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.94■■■■□ 3.34
NTN3-201ENST00000293973 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.92■■■■□ 3.34
NTN3-201ENST00000293973 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.91■■■■□ 3.34
NTN3-201ENST00000293973 STAC3Q96MF2 364 aa35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms