RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	HIP1R	O75146	1068 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	CYP2C9	P11712	490 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	GAP43	P17677	238 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF131	P52739	623 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PTK7	Q13308	1070 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	CUL4B	Q13620	913 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	HIC1	Q14526	733 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PTGIS	Q16647	500 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	UNC13D	Q70J99	1090 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	DYM	Q7RTS9	669 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	RSPH3	Q86UC2	560 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SERINC5	Q86VE9	423 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SPATA20	Q8TB22	786 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	GSDMA	Q96QA5	445 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	MAP7D2	Q96T17	732 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	REEP2	Q9BRK0	252 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		18.62	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	FAM13A	O94988	1023 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SCP2	P22307	547 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	ASIC1	P78348	528 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	POU5F1B	Q06416	359 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PSMD2	Q13200	908 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PPP2R5A	Q15172	486 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	IFT74	Q96LB3	600 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PARVG	Q9HBI0	331 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PANK4	Q9NVE7	773 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	RMND1	Q9NWS8	449 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	NOD1	Q9Y239	953 aa		18.61	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	CAND2	O75155	1236 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PLS3	P13797	630 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	IDE	P14735	1019 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	MAPK7	Q13164	816 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PNOC	Q13519	176 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	KCNB1	Q14721	858 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	CAMK4	Q16566	473 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	DAW1	Q8N136	415 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SMARCE1	Q969G3	411 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM143	Q96AN5	459 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		18.6	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691		H0YGN5	161 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	CD4	P01730	458 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	ABCD1	P33897	745 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SMTN	P53814	917 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	TFDP1	Q14186	410 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	MYCT1	Q8N699	235 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691	ARID2	Q68CP9	1835 aa		18.58	■□□□□ 0.57
TBCD-223	ENST00000576691		H0YCG3	227 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	KLRC4	O43908	158 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	B4GALT4	O60513	344 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	RHOBTB3	O94955	611 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	PRR29	P0C7W0	189 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	NAMPT	P43490	491 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	CLCN3	P51790	818 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	ODR4	Q5SWX8	454 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	KCNN1	Q92952	543 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		18.58	■□□□□ 0.56
TBCD-223	ENST00000576691	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		18.58	■□□□□ 0.56

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