RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.87	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		5.87	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		5.87	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		5.87	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	UBE2QL1	A1L167	161 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	C2orf78	A6NCI8	922 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	RASGRP1	O95267	797 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	TCIRG1	Q13488	830 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	XDH	P47989	1333 aa		5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	HIP1R	O75146	1068 aa		5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	GC	P02774	474 aa		5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	RABGGTB	P53611	331 aa		5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	IL23A	Q9NPF7	189 aa		5.85	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	IL12RB1	P42701	662 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	ANTXR2	P58335	489 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	RABL3	Q5HYI8	236 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF276	Q8N554	614 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	LENG9	Q96B70	501 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	PGBD4	Q96DM1	585 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	TCF25	Q9BQ70	676 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5.84	□□□□□ -1.47
COPS2-205	ENST00000558843	NUDT3	O95989	172 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	APP	P05067	770 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	LMO1	P25800	156 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	RGS3	P49796	1198 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	IRF9	Q00978	393 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	HTR3D	Q70Z44	454 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MB21D1	Q8N884	522 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MLST8	Q9BVC4	326 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.83	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	EFCAB14	O75071	495 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	PRL	P01236	227 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	SLC6A3	Q01959	620 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	DGKD	Q16760	1214 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	VRK3	Q8IV63	474 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	SYNE4	Q8N205	404 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MNT	Q99583	582 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		5.82	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	TOX4	O94842	621 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	RHOBTB3	O94955	611 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ROM1	Q03395	351 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	KRT40	Q6A162	431 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MFSD5	Q6N075	450 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	CLEC14A	Q86T13	490 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	E2F7	Q96AV8	911 aa		5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	NR4A1	P22736	598 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	SCLY	Q96I15	445 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	BOC	Q9BWV1	1114 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	FZD1	Q9UP38	647 aa		5.8	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	MFAP3L	O75121	409 aa		5.79	□□□□□ -1.48
COPS2-205	ENST00000558843	KRT37	O76014	449 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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