RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.07■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STK24Q9Y6E0 443 aa18.07■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LINC01553A4QN01 128 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPA1P27694 616 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PTGDRQ13258 359 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XKR9Q5GH70 373 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TCP11Q8WWU5 503 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YME1L1Q96TA2 773 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RGS18Q9NS28 235 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.06■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DGAT1O75907 488 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RARRES1P49788 294 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERVK-21P61565 698 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDIA5Q14554 519 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EMC2Q15006 297 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BRAPQ7Z569 592 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NLRP7Q8WX94 980 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCLT1Q96NL6 688 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SAMD11Q96NU1 681 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MTRQ99707 1265 aa18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 REV3LO60673 3130 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MGEA5O60502 916 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MED24O75448 989 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UPP2O95045 317 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STAG3L1P0CL83 205 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.04■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A087WZ62 844 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DENND3A2RUS2 1198 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB39O15060 712 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASAP2O43150 1006 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DGKIO75912 1065 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DSC3Q14574 896 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NACC1Q96RE7 527 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADAM2Q99965 735 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LRWD1Q9UFC0 647 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYO9BQ13459 2157 aa18.03■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C9IYK1 514 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADGRE1Q14246 886 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARNTL2Q8WYA1 636 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPOPA6NHQ4 379 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BMP15O95972 392 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYT1P21579 422 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POTEGQ6S5H5 508 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FERMT3Q86UX7 667 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSCBQ8IWL3 235 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM143Q96AN5 459 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NLRP4Q96MN2 994 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CERS4Q9HA82 394 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHST12Q9NRB3 414 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RWDD3Q9Y3V2 267 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM189BP81408 668 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POU5F1BQ06416 359 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL17AQ16552 155 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SPRED2Q7Z698 418 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms