RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.89□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 NLRP7Q8WX94 980 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CAND2O75155 1236 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 PLA2G4BP0C869 781 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.88□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM119Q4V9L6 283 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 MFSD5Q6N075 450 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SHC4Q6S5L8 630 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNK18Q7Z418 384 aa14.88□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TCP11Q8WWU5 503 aa14.88□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 DHX58Q96C10 678 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 NLRP4Q96MN2 994 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 GUCD1Q96NT3 240 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 EYSQ5T1H1 3165 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 CSF2RAP15509 400 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ITGB8P26012 769 aa14.87□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 HYIQ5T013 277 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 GPBP1Q86WP2 473 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 NME8Q8N427 588 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 FSIP1Q8NA03 581 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 RAD54LQ92698 747 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GVL5 298 aa14.86□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 RESP18Q5W5W9 173 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ADALQ6DHV7 355 aa14.86□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ARID2Q68CP9 1835 aa14.85□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CHRNA1P02708 482 aa14.85□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 PFKFB1P16118 471 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CYP11B2P19099 503 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 RFC2P35250 354 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TFDP1Q14186 410 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SV2BQ7L1I2 683 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 KSR1Q8IVT5 923 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.85□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 GBP4Q96PP9 640 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CEP89Q96ST8 783 aa14.85□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 POLD4Q9HCU8 107 aa14.85□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087X0B3 334 aa14.84□□□□□ -0.03
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PGGT1B-204ENST00000503638 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 LIG1P18858 919 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CMA1P23946 247 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 RBL2Q08999 1139 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 PAK2Q13177 524 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-204ENST00000503638 RPAINQ86UA6 219 aa14.84□□□□□ -0.03
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