RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499418.2

RNF139-AS1-201, Transcript of RNF139 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF139-AS1, Length 5,654 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MTMR2Q13614 643 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TBCCQ15814 346 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 CARD6Q9BX69 1037 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 IL1RL1Q01638 556 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TC2NQ8N9U0 490 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SPDL1Q96EA4 605 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 PARVGQ9HBI0 331 aa8.5□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 K7ENM7 598 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 M0R2N6 131 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 WNT10BO00744 389 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TBC1D12O60347 775 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 GPC4O75487 556 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 P3H4Q92791 437 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TRPC6Q9Y210 931 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 EXOC3O60645 756 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 RNF8O76064 485 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 P4HA1P13674 534 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SPP2Q13103 211 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 CEP55Q53EZ4 464 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ODR4Q5SWX8 454 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SFR1Q86XK3 245 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ADAMTS3O15072 1205 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 EYA4O95677 639 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TTC4O95801 387 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 NEK9Q8TD19 979 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TSC1Q92574 1164 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 HDAC11Q96DB2 347 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 NLRC4Q9NPP4 1024 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MTMR1Q13613 665 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ELF2Q15723 593 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 XKR9Q5GH70 373 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 RNF217Q8TC41 542 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 FGD4Q96M96 766 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 IWS1Q96ST2 819 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 DNAJC18Q9H819 358 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 CAPN9O14815 690 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MSH4O15457 936 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ICAM1P05362 532 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ARHGAP25P42331 645 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 IFT20Q8IY31 132 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 RNF169Q8NCN4 708 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 PNMA5Q96PV4 448 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ST7Q9NRC1 585 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MYH6P13533 1939 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 OPHN1O60890 802 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 RPA1P27694 616 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 CYP2J2P51589 502 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 ITKQ08881 620 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 NDUFA10O95299 355 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 EPHA7Q15375 998 aa8.48□□□□□ -1.05
RNF139-AS1-201ENST00000499418 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms