RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 HCSTQ9UBK5 93 aa31.29■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 HYAL1Q12794 435 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 MTERF2Q49AM1 385 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 NAALADL2Q58DX5 795 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL23Q8NBE8 558 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 FAM20AQ96MK3 541 aa31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM161AQ9NX61 479 aa31.28■■■□□ 2.6
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HOXB3-211ENST00000490677 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
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HOXB3-211ENST00000490677 TBX3O15119 743 aa31.25■■■□□ 2.59
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HOXB3-211ENST00000490677 IL9P15248 144 aa31.25■■■□□ 2.59
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.592e-6■■■□□ 14.6
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HOXB3-211ENST00000490677 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.59
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HOXB3-211ENST00000490677 PLA2G4FQ68DD2 849 aa31.23■■■□□ 2.59
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HOXB3-211ENST00000490677 CASD1Q96PB1 797 aa31.22■■■□□ 2.59
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HOXB3-211ENST00000490677 A0A087WZ62 844 aa31.19■■■□□ 2.58
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HOXB3-211ENST00000490677 CLLU1OSQ5K130 101 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 KSR1Q8IVT5 923 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM117Q9H0C3 514 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0U1RQF3 1178 aa31.18■■■□□ 2.58
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HOXB3-211ENST00000490677 EPHX3Q9H6B9 360 aa31.18■■■□□ 2.58
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HOXB3-211ENST00000490677 RHPN2Q8IUC4 686 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 SCLT1Q96NL6 688 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 KIF2CQ99661 725 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 TRAIPQ9BWF2 469 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 IFT122Q9HBG6 1241 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB39O15060 712 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 EP400NLQ6ZTU2 488 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
HOXB3-211ENST00000490677 SLFN12Q8IYM2 578 aa31.15■■■□□ 2.58
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