RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438518.5

HDAC6-208, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-208ENST00000438518 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.39■□□□□ 0.85
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HDAC6-208ENST00000438518 TMEM143Q96AN5 459 aa20.36■□□□□ 0.85
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HDAC6-208ENST00000438518 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.36■□□□□ 0.85
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HDAC6-208ENST00000438518 SMTNP53814 917 aa20.35■□□□□ 0.85
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HDAC6-208ENST00000438518 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.35■□□□□ 0.85
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HDAC6-208ENST00000438518 SQORQ9Y6N5 450 aa20.35■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 CKBP12277 381 aa20.34■□□□□ 0.85
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HDAC6-208ENST00000438518 GLRA2P23416 452 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 THPOP40225 353 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 GPC3P51654 580 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 DRP2Q13474 957 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 KCNB1Q14721 858 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.34■□□□□ 0.85
HDAC6-208ENST00000438518 GSDMAQ96QA5 445 aa20.34■□□□□ 0.85
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