RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAP7D2Q96T17 732 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSD17B14Q9BPX1 270 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PBX4Q9BYU1 374 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCN5AQ14524 2016 aa9.12□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TET1Q8NFU7 2136 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AMHP03971 560 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATP2B1P20020 1258 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MUTP22033 750 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCM7P33993 719 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTGDRQ13258 359 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LPIN1Q14693 890 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF174Q15697 407 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UGCGQ16739 394 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCTP1Q6DN14 999 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANO5Q75V66 913 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TTC13Q8NBP0 860 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BANK1Q8NDB2 785 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERMNQ8TAM6 284 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOP1MTQ969P6 601 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CEP89Q96ST8 783 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAD9AQ99638 391 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB34Q9BZG1 259 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF576Q9H609 170 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYP26B1Q9NR63 512 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANKEF1Q9NU02 776 aa9.11□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ENPP3O14638 875 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPR182O15218 404 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASAP2O43150 1006 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLL1O43897 1013 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPR32O75388 356 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPS6KA5O75582 802 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GJB5O95377 273 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR52Z1P0C646 297 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GHRP10912 638 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RFC5P40937 340 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRPHP41219 470 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTERF2Q49AM1 385 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BRAPQ7Z569 592 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TPH2Q8IWU9 490 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCP11Q8WWU5 503 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DYDC2Q96IM9 177 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LXNQ9BS40 222 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGL1Q9NZL6 768 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PADI3Q9ULW8 664 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INSL6Q9Y581 213 aa9.1□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WDR81Q562E7 1941 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WNT7AO00755 349 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BMP15O95972 392 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPA1P27694 616 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TECP42680 631 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PAK2Q13177 524 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCTN1Q2MV58 587 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PADI6Q6TGC4 694 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF410Q86VK4 478 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CEP170P1Q96L14 293 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NACC1Q96RE7 527 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AKT3Q9Y243 479 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EVPLQ92817 2033 aa9.09□□□□□ -0.95
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DGAT1O75907 488 aa9.08□□□□□ -0.96
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD52P31358 61 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms