RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 STAT1P42224 750 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 PMS2P54278 862 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CYP4A11Q02928 519 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 PALB2Q86YC2 1186 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 DNM3Q9UQ16 869 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 NCANO14594 1321 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 FOCADQ5VW36 1801 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 C21orf2O43822 256 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ELF1P32519 619 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CENPTQ96BT3 561 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 AZI2Q9H6S1 392 aa20.38■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 RAD21O60216 631 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SOX5P35711 763 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 RPAINQ86UA6 219 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 HOOK3Q86VS8 718 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 JAMLQ86YT9 394 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 BORCS6Q96GS4 357 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 COG5Q9UP83 839 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 TGFB1I1O43294 461 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MGRN1O60291 552 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 NUDT17P0C025 328 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 GHRP10912 638 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MMP13P45452 471 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 THAP2Q9H0W7 228 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.37■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 RGL2O15211 777 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 TMEM253P0C7T8 217 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 IL1R1P14778 569 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CYP3A7P24462 503 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 NF2P35240 595 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC29A2Q14542 456 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 NEK9Q8TD19 979 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 C18orf8Q96DM3 657 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MBOAT7Q96N66 472 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 GPR88Q9GZN0 384 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 RPA1P27694 616 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 DENND2CQ68D51 928 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 KSR1Q8IVT5 923 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 P3H4Q92791 437 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SYT11Q9BT88 431 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MXD3Q9BW11 206 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.36■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 RPTORQ8N122 1335 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CARD9Q9H257 536 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MEIS2O14770 477 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 KRT13P13646 458 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 LMNB1P20700 586 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGAP4P98171 946 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 COG2Q14746 738 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP1R7Q15435 360 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 MSL1Q68DK7 614 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 PGM2Q96G03 612 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SUFUQ9UMX1 484 aa20.35■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.34■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SHMT1P34896 483 aa20.34■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SLCO1A2P46721 670 aa20.34■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 SNAP25P60880 206 aa20.34■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEFHP1-201ENST00000412845 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms