RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa25.14■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP104O60308 925 aa25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 HSD17B4P51659 736 aa25.13■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 A6NNZ2 444 aa25.12■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R37O75864 691 aa25.12■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 CYP2J2P51589 502 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 TNIP1Q15025 636 aa25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 TUBB8Q3ZCM7 444 aa25.12■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.614e-7■■□□□ 11.9
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.12■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 FAM83AQ86UY5 434 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 IQCKQ8N0W5 287 aa25.11■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.11■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 KSR1Q8IVT5 923 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 CD302Q8IX05 232 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 METTL13Q8N6R0 699 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 ZIM3Q96PE6 472 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 SYT11Q9BT88 431 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 ISCUQ9H1K1 167 aa25.11■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 NT5DC3Q86UY8 548 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 BANK1Q8NDB2 785 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.1■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 RFFLQ8WZ73 363 aa25.1■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 AMFRQ9UKV5 643 aa25.09■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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RABGGTA-202ENST00000399409 GPR88Q9GZN0 384 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.09■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
RABGGTA-202ENST00000399409 ITGB5P18084 799 aa25.08■■□□□ 1.61
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