RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 NAB2Q15742 525 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ILDR2Q71H61 639 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 HSD17B4P51659 736 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CABS1Q96KC9 395 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 TBX3O15119 743 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 FNTAP49354 379 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 TNNC1P63316 161 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 KCNMA1Q12791 1236 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POLD4Q9HCU8 107 aa21.99■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POTEFA5A3E0 1075 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MEIS1O00470 390 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ZBED4O75132 1171 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POTEIP0CG38 1075 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POTEGQ6S5H5 508 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MOB2Q70IA6 237 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 DDX12PQ92771 950 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 FAM20AQ96MK3 541 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MDH1P40925 334 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 NLRP14Q86W24 1093 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 IL31RAQ8NI17 732 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 VAV3Q9UKW4 847 aa21.98■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 EML1O00423 815 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ARP10275 920 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PSMC6P62333 389 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CYP4A11Q02928 519 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PSMD2Q13200 908 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CEP55Q53EZ4 464 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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VGF-201ENST00000249330 LRRC27Q9C0I9 530 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 C19orf81C9J6K1 198 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MYO1FO00160 1098 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 EHHADHQ08426 723 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 GPR162Q16538 588 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 HYIQ5T013 277 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PLAAQ9Y263 795 aa21.97■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CHMP2AO43633 222 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 TLR2O60603 784 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.96■■□□□ 1.11
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VGF-201ENST00000249330 LRRC41Q15345 812 aa21.96■■□□□ 1.11
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VGF-201ENST00000249330 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 TAF4BQ92750 862 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 RAD51CO43502 376 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 C12orf42Q96LP6 360 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 TAAR1Q96RJ0 339 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 RGL1Q9NZL6 768 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.96■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ITGB5P18084 799 aa21.95■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
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VGF-201ENST00000249330 SLC18A3Q16572 532 aa21.95■■□□□ 1.11
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VGF-201ENST00000249330 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.95■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 PEX10O60683 326 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 NOL4O94818 638 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 COG2Q14746 738 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.95■■□□□ 1.1
VGF-201ENST00000249330 KLHL7Q8IXQ5 586 aa21.95■■□□□ 1.1
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