RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Colgalt1Q8K297 617 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp64Q99KE8 643 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf186Q9D241 226 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pex3Q9QXY9 372 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc26a4Q9R155 780 aa25.24■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il4rP16382 810 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmp3P28862 477 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 E2f8Q58FA4 860 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ScapQ6GQT6 1276 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dalrd3Q6PJN8 538 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam20aQ8CID3 541 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cabp7Q91ZM8 215 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Polr3fQ921X6 316 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dqx1Q924H9 718 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ly6kQ9CWP4 154 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt17Q9QWL7 433 aa25.23■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Man1b1A2AJ15 658 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim30bE9PVL6 203 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r87E9PZX4 848 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pnpla5Q32LZ8 432 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd300aQ6SJQ0 318 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Npas4Q8BGD7 802 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Btnl9Q8BJE2 536 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina3bQ8BYY9 420 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcnv1Q8BZN2 503 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam160b1Q8CDM8 764 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scrn1Q9CZC8 414 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eya4Q9Z191 616 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arih2Q9Z1K6 492 aa25.22■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt36B1AQ75 473 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Idh1O88844 414 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SarsP26638 512 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MaeaQ4VC33 396 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Defa-rs10Q64263 91 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PogkQ80TC5 607 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fut11Q8BHC9 489 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wrap53Q8VC51 532 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mgea5Q9EQQ9 916 aa25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map7d2A2AG50 781 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap6O54834 987 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asprv1Q09PK2 339 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vps16Q920Q4 839 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pus10Q9D3U0 527 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tube1Q9D6T1 475 aa25.2■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2b23E9Q593 491 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtenO08586 403 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grin1P35438 938 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sparcl1P70663 650 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Grxcr1Q50H32 290 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa1841Q68FF0 718 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hdac4Q6NZM9 1076 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zmym6Q8BS54 1249 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam78aQ8C552 283 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf467Q8JZL0 594 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk38Q91VJ4 465 aa25.19■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm45194A0A140LJG2 572 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3739L7N296 216 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Got1P05201 413 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xrcc6P23475 608 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gbp1Q01514 589 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hexim2Q3TVI4 313 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scarf1Q5ND28 820 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wnt8aQ64527 354 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf653Q6YND2 615 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Daam2Q80U19 1115 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phtf1Q9QZ09 761 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa25.18■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt78E9Q0F0 1068 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ifnar1P33896 590 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Resp18P47939 175 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PoliQ6R3M4 717 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FtoQ8BGW1 502 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Thap3Q8BJ25 218 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt79Q8VED5 531 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PccaQ91ZA3 724 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CenpsQ9D084 142 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm45015A0A140LII9 184 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm18336A0A140LIU8 765 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm38655A0A286YDK6 273 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oas1fQ14AZ4 364 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Capn13Q3UW68 665 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Colgalt2Q6NVG7 625 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms