RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624484.1

CU633906.4-201, humanhuman

BASIC

Gene CU633906.4, Length 1,023 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633906.4-201ENST00000624484 RLFQ13129 1914 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 RSPH10B2B2RC85 870 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 STAM2O75886 525 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 NDUFA10O95299 355 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 RSPH10BP0C881 870 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MYBP10242 640 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 GUCY2CP25092 1073 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 QARSP47897 775 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ERVK-24P63145 666 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CDK17Q00537 523 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ARHGEF6Q15052 776 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CCL15Q16663 113 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TRIM65Q6PJ69 517 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 REPS2Q8NFH8 660 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 RDM1Q8NG50 284 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 GPRASP2Q96D09 838 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CDHR1Q96JP9 859 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MAP7D2Q96T17 732 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TIPINQ9BVW5 301 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MGAMO43451 1857 aa11.17□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MUC3AQ02505 3323 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 WDR64B1ANS9 1081 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 DHX15O43143 795 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 LYPLA2O95372 231 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 NR3C1P04150 777 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 NR3C2P08235 984 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 KLK7P49862 253 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 PSMC5P62195 406 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ALCAMQ13740 583 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MEA1Q16626 185 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ODR4Q5SWX8 454 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 PADI6Q6TGC4 694 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 Q7L0L9 218 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 KIAA1328Q86T90 577 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MNS1Q8NEH6 495 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CHST13Q8NET6 341 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 FBXO40Q9UH90 709 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.16□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 SFI1A8K8P3 1242 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 HIP1RO75146 1068 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CTGFP29279 349 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CASP5P51878 434 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ZNF131P52739 623 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TUBB2AQ13885 445 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 VGLL4Q14135 290 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 SPA17Q15506 151 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 NFIL3Q16649 462 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 GNPTABQ3T906 1256 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 C4orf19Q8IY42 314 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CCDC42Q96M95 316 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CHP1Q99653 195 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 TUBB2BQ9BVA1 445 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 DEF6Q9H4E7 631 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 CEP72Q9P209 647 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 RIPK3Q9Y572 518 aa11.15□□□□□ -0.62
CU633906.4-201ENST00000624484 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms